109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0475 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  100 
 
 
235 aa  486  1e-136  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  40 
 
 
229 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  40 
 
 
229 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  40.27 
 
 
228 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  38.67 
 
 
229 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  35.11 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  37.71 
 
 
232 aa  151  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  35.68 
 
 
225 aa  143  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  33.79 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  37.33 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  30.43 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  29.46 
 
 
228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  29.69 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  30.74 
 
 
240 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  25.45 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  23.91 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  27.19 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  26.67 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  25.42 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  22.05 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  23.4 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  24.35 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  25.54 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  24.79 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  23.32 
 
 
232 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  26.05 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  23.65 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  24.57 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  25.76 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  24.35 
 
 
223 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  26.36 
 
 
233 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  25.33 
 
 
227 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  21.93 
 
 
240 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  24.56 
 
 
225 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  23.81 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  23.43 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  21.74 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  25.21 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  21.74 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  26.29 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  22.63 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  25 
 
 
226 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  25.43 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  24.58 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  21.9 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  24.69 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  24.08 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  21.62 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  21.2 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  21.15 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  21.15 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  22.08 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  27.09 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  23.3 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2456  urease accessory protein UreF  24.89 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  26.18 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  21.07 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  24.58 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  24.68 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  25.78 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  21.68 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  24.46 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  25.65 
 
 
224 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  24.46 
 
 
236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  23.53 
 
 
224 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  25.1 
 
 
226 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  26 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  26 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  25.74 
 
 
226 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  25.3 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0831  urease accessory protein UreF  23.93 
 
 
228 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  24.37 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  22.95 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  22.45 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  26 
 
 
226 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  23.97 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  24.9 
 
 
229 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08881  urease accessory protein UreF  23.5 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  23.42 
 
 
199 aa  46.6  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  20.43 
 
 
225 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  22.77 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08901  urease accessory protein UreF  23.18 
 
 
228 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.460278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  26.2 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  23.27 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  21.05 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  21.01 
 
 
288 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  22 
 
 
269 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  22.54 
 
 
226 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  22.97 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  23.18 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  21.95 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  25.65 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  31.58 
 
 
220 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>