50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1681 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  31.06 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  31.8 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  28.14 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  32.13 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  27.48 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  35.37 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  29.92 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  29.09 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  26.58 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  31.74 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  31.05 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  24.11 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  32 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  23.18 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  24.43 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  26.92 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  22.71 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  27.93 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  24.67 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  25 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  23.72 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  26.54 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  21.97 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  30.57 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  24.55 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  26.32 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  26.32 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  26.32 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  21.62 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  21.62 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  21.27 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  23.08 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  32.8 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  29.96 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  32.53 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  27.59 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  36.09 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  27.35 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  27.15 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  25.59 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  27.15 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  26.92 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  29.52 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  30.37 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  25.66 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 240 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  27.1 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.31623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>