124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1135 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  99.56 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  99.56 
 
 
228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  51.79 
 
 
243 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  45.78 
 
 
240 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  45.78 
 
 
240 aa  207  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  47.56 
 
 
240 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  29.49 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  26.7 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  27.47 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  26.97 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  29.26 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  25.68 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  28.18 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  28.44 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  27.42 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  27.23 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  22.81 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  30.65 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  30.65 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  25.68 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  28.38 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  26.25 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  24.78 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  26.09 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  26.16 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  25.21 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  24.36 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  26.91 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  24.45 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  23.75 
 
 
230 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  23.79 
 
 
288 aa  63.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  22.37 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  23.43 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  23.81 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  23.05 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  20.98 
 
 
240 aa  60.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  26.46 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  26.21 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  21.17 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  26.01 
 
 
247 aa  59.7  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  23.21 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  22.08 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  26.2 
 
 
288 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  23.65 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  22.27 
 
 
228 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  25.34 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  24.45 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  25.42 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  21.37 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  20.94 
 
 
226 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  23.58 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  22.22 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  21.15 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  21.49 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  23.18 
 
 
227 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  21.28 
 
 
226 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  23.93 
 
 
229 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  21.74 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  25.79 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  24.66 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  21.82 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  21.46 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  21.3 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  27.55 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  27.16 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  24.24 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  22.67 
 
 
199 aa  52.4  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  24.77 
 
 
226 aa  52  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  19.74 
 
 
236 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  25.34 
 
 
224 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  26.46 
 
 
226 aa  52  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  22.43 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  23.74 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  21.74 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  24.78 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  23.28 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  22.98 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
226 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  23.48 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  23.11 
 
 
231 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  29.01 
 
 
218 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  29.7 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  22.67 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  22.32 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  24.86 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  32.35 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  20.96 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  22.33 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  20.61 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  21.03 
 
 
228 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  34.55 
 
 
269 aa  45.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  20.09 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  26.39 
 
 
211 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.208528 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>