63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0885 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0885  urease accessory protein UreF  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  28 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  31.75 
 
 		 223 aa  68.2  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  28 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  27.56 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  26.91 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  28 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  27.8 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  27.98 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  27.98 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  27.8 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  27.98 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  25.78 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  27.98 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  27.98 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  25.54 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  24.55 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  22.47 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  25.68 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  24.07 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  24.67 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25.91 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  25.44 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  24.68 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  24.68 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  26.11 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  25.11 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  25.45 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  23.79 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  25.79 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  24.64 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  25.48 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  23.98 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  24.23 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  25.34 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  20.35 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  22.67 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  22.67 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  22.67 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  22.77 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  26.51 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  23.42 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  24.11 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  21.4 
 
 		 238 aa  45.8  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  21.52 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  22.83 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  24.88 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  22.47 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  21.89 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  23.08 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  22.07 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  23.94 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  22.22 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  25.23 
 
 		 228 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  23.91 
 
 		 227 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  21.86 
 
 		 259 aa  42.4  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  24.67 
 
 		 238 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  24.9 
 
 		 266 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  21.46 
 
 		 232 aa  41.2  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>