71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0061 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0061  Urease accessory protein UreF  100 
 
 		 239 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5118  Urease accessory protein UreF  34.38 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  31.25 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2199  urease accessory protein UreF  33.2 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0590668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  31.25 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  33.18 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  28.76 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  31.54 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2412  urease accessory protein UreF  32.63 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  25 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  28.7 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  28.17 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  29.13 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  29.13 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  29.13 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  29.73 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  24 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2064  Urease accessory protein UreF  36.22 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000168254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2716  urease accessory protein UreF  32.11 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  23.91 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  28.51 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  28.57 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03460  urease accessory protein UreF  31 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6191  urease accessory protein UreF  34.89 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00827459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  34.5 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1681  urease accessory protein UreF  35.37 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  22.37 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  24.88 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1195  urease accessory protein UreF  36 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  32.77 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  19.64 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  19.64 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  22.71 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  24.48 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1134  Urease accessory protein UreF  36.84 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1355  Urease accessory protein UreF  35.56 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  40.34 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1873  urease accessory protein UreF  20.87 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.674114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  20.52 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  32.46 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  30.26 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  31.58 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  29.39 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  28.89 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  35.76 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  37.07 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  30.13 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  31.47 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  27.85 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  27.19 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  30.13 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  28.88 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  38.98 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4444  urease accessory protein UreF  30.26 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.8214 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04770  conserved hypothetical protein  42.19 
 
 		 318 aa  45.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  32.24 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  29.82 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  30.7 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  27.68 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  32.04 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  28.22 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  34.12 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  31.76 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  27.36 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  28.99 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  29.39 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  26.87 
 
 		 224 aa  42  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  30.61 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  28.63 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  28.19 
 
 		 224 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>