111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0984 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0984  urease accessory protein UreF  100 
 
 
269 aa  548  1e-155  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.341569  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  32.65 
 
 
228 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  35.18 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  34.52 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  34.27 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  34.78 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  35.48 
 
 
226 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  31.3 
 
 
221 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  34.26 
 
 
224 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  33.59 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  32.45 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  34.15 
 
 
231 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  34.29 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  32.8 
 
 
224 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  34.82 
 
 
224 aa  109  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  34.66 
 
 
224 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  31.73 
 
 
230 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
226 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
226 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  34.27 
 
 
226 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
226 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  34.68 
 
 
236 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  33.6 
 
 
233 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
236 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
236 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
226 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
226 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
236 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
236 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  35.89 
 
 
226 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  34.01 
 
 
224 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  36.03 
 
 
224 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
226 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  33.47 
 
 
226 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  35.2 
 
 
235 aa  105  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  34.55 
 
 
223 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  33.59 
 
 
229 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  33.2 
 
 
229 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  33.2 
 
 
232 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  31.38 
 
 
288 aa  103  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  33.73 
 
 
226 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  31.3 
 
 
253 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  32.4 
 
 
229 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  34.68 
 
 
226 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  33.74 
 
 
223 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  32 
 
 
251 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  32.13 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  29.8 
 
 
228 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  28.81 
 
 
230 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  32.66 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  30.38 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  30.08 
 
 
224 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  29.32 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  31.4 
 
 
224 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  30.99 
 
 
224 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  30.58 
 
 
224 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  32.38 
 
 
230 aa  85.9  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  28.23 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  30.61 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2932  urease accessory protein UreF  28.87 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.617644  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  30.23 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  30.89 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  26.58 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3468  urease accessory protein UreF  28.29 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000115011  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  28.11 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29761  urease accessory protein UreF  26.74 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  24.11 
 
 
240 aa  66.6  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  27.23 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  27.27 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  28.69 
 
 
244 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  27.05 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  27.71 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0327  urease accessory protein  25.2 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  26.69 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  26.23 
 
 
225 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  25.82 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  27.42 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  24.29 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2622  urease accessory protein F  26.51 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0673782  normal  0.796864 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  26.64 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 
250 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  23.35 
 
 
223 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  26.74 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  19.05 
 
 
232 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2316  urease accessory protein UreF  24.6 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.495239  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2359  urease accessory protein UreF  24.6 
 
 
229 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  28.49 
 
 
210 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2252  urease accessory protein F  26.19 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0475  urease accessory protein UreF  22 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  23.81 
 
 
214 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0685  urease accessory protein UreF  25.68 
 
 
228 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  24.65 
 
 
240 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  24.06 
 
 
240 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  28.57 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  24.74 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  25 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  25.79 
 
 
210 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  28.74 
 
 
210 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  25.2 
 
 
228 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>