50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1562 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  100 
 
 		 957 aa  1967    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  33.25 
 
 		 989 aa  178  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  23.89 
 
 		 911 aa  71.6  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1039 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  23.6 
 
 		 919 aa  68.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.99 
 
 		 994 aa  66.6  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  24.3 
 
 		 1001 aa  58.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.3 
 
 		 984 aa  58.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  25.52 
 
 		 1016 aa  57  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.98 
 
 		 951 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  21.24 
 
 		 909 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  23.6 
 
 		 1064 aa  56.6  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  25.13 
 
 		 1052 aa  57  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  25 
 
 		 1052 aa  56.6  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.46 
 
 		 976 aa  56.2  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  25.07 
 
 		 1052 aa  56.2  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  20.84 
 
 		 968 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4407  ATP-dependent nuclease subunit B-like  27.73 
 
 		 1045 aa  55.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.63 
 
 		 1042 aa  54.7  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  28.42 
 
 		 922 aa  54.7  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1053 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.16 
 
 		 836 aa  52.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  21.49 
 
 		 993 aa  52  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  21.88 
 
 		 780 aa  52  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  20.06 
 
 		 781 aa  51.6  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.71 
 
 		 969 aa  51.2  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.71 
 
 		 969 aa  51.2  0.00008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  29.52 
 
 		 304 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  19.79 
 
 		 803 aa  51.2  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  24.12 
 
 		 1064 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  21.89 
 
 		 1059 aa  49.7  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0086  hypothetical protein  25.85 
 
 		 945 aa  50.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  25.43 
 
 		 1041 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  22 
 
 		 960 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1049 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.36 
 
 		 1049 aa  49.3  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  28.26 
 
 		 896 aa  48.9  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  25 
 
 		 298 aa  48.5  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.78 
 
 		 968 aa  47.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  28.49 
 
 		 864 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.48 
 
 		 906 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  25.82 
 
 		 913 aa  47  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  24.86 
 
 		 908 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  22.88 
 
 		 991 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.9 
 
 		 1048 aa  46.2  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  24 
 
 		 962 aa  45.1  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  25.73 
 
 		 947 aa  44.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  27.88 
 
 		 846 aa  44.7  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  24.91 
 
 		 990 aa  44.7  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1321  methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 915 aa  44.3  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>