More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7039 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7039  ribosomal protein S6  100 
 
 		 118 aa  236  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  72.16 
 
 		 111 aa  156  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  76.6 
 
 		 96 aa  153  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  75.53 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  73.12 
 
 		 93 aa  147  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  70.65 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  71.28 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  70.97 
 
 		 94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  70.21 
 
 		 96 aa  144  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  72.83 
 
 		 96 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  71.28 
 
 		 96 aa  143  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  71.74 
 
 		 96 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  71.74 
 
 		 96 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  71.74 
 
 		 96 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  71.74 
 
 		 96 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  67.02 
 
 		 97 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  66.04 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  68.48 
 
 		 95 aa  141  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2133  SSU ribosomal protein S6P  66.3 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  70.65 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  68.09 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  69.57 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  66.3 
 
 		 98 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5369  ribosomal protein S6  68.13 
 
 		 102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  68.48 
 
 		 96 aa  136  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  64.89 
 
 		 96 aa  134  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  59.79 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  59.79 
 
 		 101 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  63.83 
 
 		 95 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4339  ribosomal protein S6  64.21 
 
 		 98 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0337  ribosomal protein S6  62.89 
 
 		 101 aa  130  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.644788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4522  30S ribosomal protein S6  63.21 
 
 		 108 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  52.58 
 
 		 101 aa  117  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  55.43 
 
 		 96 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  52.17 
 
 		 95 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26590  SSU ribosomal protein S6P  51.09 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.175156 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 95 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  41.3 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 98 aa  84.3  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  42.22 
 
 		 96 aa  84  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  41.67 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1363  30S ribosomal protein S6  36.67 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000620601  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0778  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 98 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  34.65 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  31.91 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3586  30S ribosomal protein S6  32.11 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0940753  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3038  30S ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  26.89 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4537  30S ribosomal protein S6  30.7 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287316  normal  0.325201 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  38.3 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2766  30S ribosomal protein S6  30.09 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.431916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3064  30S ribosomal protein S6  32.11 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.234735  normal  0.218428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2386  30S ribosomal protein S6  30.19 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4877  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4758  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734543 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4212  30S ribosomal protein S6  31.19 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.553377  hitchhiker  0.000271078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4668  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0417729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  34.48 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4934  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000104766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0757  30S ribosomal protein S6  31.19 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.228949  hitchhiker  0.00000160404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4933  ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0581  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3284  30S ribosomal protein S6  29.57 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0114214  hitchhiker  0.000227969 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0534  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.587814  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3361  ribosomal protein S6  32.32 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0849  SSU ribosomal protein S6P  33.65 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.759966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  30.3 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0645  30S ribosomal protein S6  28.71 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.793975  hitchhiker  0.000526957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00023  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>