249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4615 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
392 aa  770    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  63.66 
 
 
405 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  54.55 
 
 
434 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  45.17 
 
 
413 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  40.57 
 
 
418 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  39.37 
 
 
496 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  42.23 
 
 
381 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  35.56 
 
 
390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  36.34 
 
 
400 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  33.24 
 
 
402 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  34.53 
 
 
388 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 
386 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  29.84 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  27.98 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  34.75 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  34.75 
 
 
388 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  33.24 
 
 
374 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  34.12 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  33.59 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.03 
 
 
403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  32.68 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  32.77 
 
 
400 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  29.36 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  32.08 
 
 
396 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  30.28 
 
 
394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  28.99 
 
 
370 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  32.01 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  32.76 
 
 
399 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  32.85 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  29.59 
 
 
415 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  35.04 
 
 
393 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  31.52 
 
 
407 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  32.69 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  35.08 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  31.78 
 
 
424 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  35.08 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  35.08 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  31.34 
 
 
404 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  35.45 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 
371 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  30 
 
 
371 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  32.58 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.27 
 
 
398 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  29.68 
 
 
373 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  27.76 
 
 
384 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  30.06 
 
 
467 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  35.23 
 
 
396 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  30.68 
 
 
393 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  31.32 
 
 
402 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  30.66 
 
 
397 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  27.13 
 
 
423 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  30.99 
 
 
377 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  29.43 
 
 
408 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  30.43 
 
 
393 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  30.49 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  33.42 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  29.1 
 
 
403 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 
400 aa  93.6  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  24.33 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  26.54 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  29.45 
 
 
387 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 
411 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  31.45 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 
377 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  30.68 
 
 
376 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  30.42 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  27.09 
 
 
368 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  26.82 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  28.25 
 
 
376 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  27.95 
 
 
376 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  30 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  30.42 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0125  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  29.97 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  28.4 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.49 
 
 
376 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.06 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  31.55 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.61 
 
 
377 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  27.97 
 
 
386 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2189  Kynurenine 3-monooxygenase  26.88 
 
 
440 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  30.43 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  30.34 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  28.45 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  29.71 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  30 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  26.94 
 
 
461 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  29.41 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.15 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  29.69 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  25.93 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.82 
 
 
378 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  29.61 
 
 
378 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  26.1 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  26.59 
 
 
364 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  26.33 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  26.91 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  26.09 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  26.3 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  28.42 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>