130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3411 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3411  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 469 aa  931    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21750  major facilitator superfamily permease  64.77 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.109771  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2301  major facilitator superfamily permease  49.67 
 
 		 453 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.334509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3164  major facilitator superfamily permease  48.37 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2708  major facilitator superfamily MFS_1  49.68 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0342766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2972  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.737462  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0390  major facilitator superfamily permease  47.82 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.778281  normal  0.55351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5507  major facilitator superfamily permease/BtlA- like protein  45.3 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.462661  normal  0.0808457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1801  major facilitator superfamily protein  46.49 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2485  hypothetical protein  48.51 
 
 		 464 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2342  hypothetical protein  48.94 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968844 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14630  major facilitator superfamily permease  45.45 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1758  putative transporter  46.96 
 
 		 460 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2277  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 469 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.419016  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2670  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.88531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5316  major facilitator superfamily MFS_1  40.71 
 
 		 572 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1893  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 458 aa  300  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2328  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 465 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1854  major facilitator superfamily permease/ BtlA-like  35.06 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000121925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0030  permease  33.48 
 
 		 437 aa  236  7e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345375  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1904  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 430 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2251  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 439 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2003  permease  29.86 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.307053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1276  hypothetical protein  30.98 
 
 		 431 aa  203  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.322939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0335  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 454 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22460  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0150  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 443 aa  196  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01490  major facilitator superfamily permease  30.87 
 
 		 408 aa  189  9e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0591182  normal  0.340851 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12428  hypothetical protein  28.12 
 
 		 441 aa  187  5e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0597064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2748  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 439 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437943  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1838  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.047376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2713  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0507  hypothetical protein  26.32 
 
 		 427 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.130258  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0373  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 427 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0458  hypothetical protein  26.04 
 
 		 427 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000401747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0507  hypothetical protein  26.48 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0379  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000021693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0370  major facilitator superfamily permease  26.26 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.902830000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0367  major facilitator superfamily permease  26.26 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000714912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0393  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0437  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4866  hypothetical protein  26.26 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0406  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0379  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 427 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000550837  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1522  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.101861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3450  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3786  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1654  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1720  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.493867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1012  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 428 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.389524 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1090  putative permease  28.81 
 
 		 425 aa  149  8e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0778903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1624  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 421 aa  148  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0936  MFS transporter family protein  27.16 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0146  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.243784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1472  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.905727  normal  0.384031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1324  MFS transporter family protein  28.34 
 
 		 425 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2937  major facilitator superfamily transporter  25.27 
 
 		 435 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2758  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 447 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07591  Autophagy-related protein 22-2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AVT9]  25.46 
 
 		 593 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2044  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0220318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2515  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1842  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0022  major facilitator transporter  27.77 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0334  hypothetical protein  25.39 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1274  putative integral membrane protein  28.86 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0315  hypothetical protein  24.94 
 
 		 424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0027  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2130  major facilitator family transporter  26.02 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0083  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.339646  normal  0.26187 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0193  transporter, MFS superfamily  26.02 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3661  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1817  hypothetical protein  25.67 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4238  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 462 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3914  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.133818 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0568  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 468 aa  106  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1085  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2014  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0721  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 465 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2069  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 460 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.692197  normal  0.259713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3166  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.704444  normal  0.18034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0192  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25210  major facilitator superfamily permease  27.45 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.302409  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2546  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 449 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.146508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1010  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4369  hypothetical protein  25.96 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.486519  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0160  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 462 aa  93.6  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0387  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 437 aa  93.2  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0133748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0635  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 456 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0322  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 467 aa  90.1  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.169916  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0343  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 454 aa  89.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.911823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2658  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 469 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.494745  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1429  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.218982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1700  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3202  major facilitator superfamily MFS_1  21.46 
 
 		 444 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0020  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 456 aa  86.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3337  major facilitator superfamily (MFS) transporter  24.8 
 
 		 443 aa  86.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3661  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07437  Autophagy-related protein 22-1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW93]  25.52 
 
 		 588 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0083743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3264  hypothetical protein  25.62 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3874  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>