More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0514 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 377 aa  762    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  74.8 
 
 		 376 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  72.19 
 
 		 375 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  70.77 
 
 		 374 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  72.36 
 
 		 395 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  69.71 
 
 		 381 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  71.27 
 
 		 371 aa  544  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  70.65 
 
 		 369 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  70.11 
 
 		 376 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  72.12 
 
 		 374 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  69.02 
 
 		 370 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  68.46 
 
 		 373 aa  528  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  67.57 
 
 		 370 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  67.75 
 
 		 373 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  71.74 
 
 		 370 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  71.74 
 
 		 370 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  71.74 
 
 		 370 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  68.98 
 
 		 374 aa  518  1e-146  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  68.83 
 
 		 370 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  70.92 
 
 		 372 aa  512  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  68.56 
 
 		 376 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  65.86 
 
 		 375 aa  498  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  62.6 
 
 		 377 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  62.53 
 
 		 376 aa  482  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  61.19 
 
 		 376 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  61.5 
 
 		 375 aa  475  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  65.23 
 
 		 374 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  60.96 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  62.37 
 
 		 385 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  61.02 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  57.68 
 
 		 372 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  56.79 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  58.51 
 
 		 379 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  60.11 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  57.26 
 
 		 380 aa  415  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  58.65 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  54.03 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  57.33 
 
 		 378 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  42.55 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  30.85 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  26.4 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  28.41 
 
 		 352 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  26.33 
 
 		 357 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  28.33 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  27.12 
 
 		 363 aa  99.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  27.07 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  24.31 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  26.2 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  26.46 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  26.45 
 
 		 357 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  26.76 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  25.87 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  25.87 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  25.78 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  25.84 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  26.98 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  26.79 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  25.96 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  26.45 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0477  phosphoserine aminotransferase  24.42 
 
 		 393 aa  82.8  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108745 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5460  phosphoserine aminotransferase  27.46 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  27.13 
 
 		 379 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  24.26 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  24.8 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  25.56 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  24.87 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0659  phosphoserine aminotransferase  26.75 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.381901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1294  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303177  normal  0.291609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  26.2 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  23.82 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2000  phosphoserine aminotransferase  27.07 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  22.68 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1676  phosphoserine aminotransferase  24.66 
 
 		 359 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1732  phosphoserine aminotransferase  26.52 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  24.93 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  24.2 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  25.34 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  23.58 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  26.72 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  22.68 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  25.87 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  23.04 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  24.93 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0670  phosphoserine aminotransferase  26.23 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.786402  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  24.93 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  23.87 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6799  phosphoserine aminotransferase  25.64 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2190  phosphoserine aminotransferase  25.27 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  24.81 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2469  phosphoserine aminotransferase  25.62 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  26.49 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  24.74 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3261  phosphoserine aminotransferase  25.27 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3294  phosphoserine aminotransferase  24.93 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.484409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0611  phosphoserine aminotransferase  25.44 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>