214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0367 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 284 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 285 aa  344  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  56.83 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  54.15 
 
 		 297 aa  268  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  52.38 
 
 		 302 aa  261  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  45.88 
 
 		 294 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  47.65 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  45.49 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  46.83 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  45.32 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  45.85 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  45.32 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  46.13 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  42.76 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  45.76 
 
 		 303 aa  205  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  45.14 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  45.45 
 
 		 313 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  43.64 
 
 		 297 aa  201  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  42.44 
 
 		 302 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  44.4 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  41.09 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  41.45 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  43.96 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  43.21 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  45.52 
 
 		 307 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  44.52 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  43.53 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  41.61 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  45.35 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  45.62 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  45.04 
 
 		 313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  43.89 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2579  helix-turn-helix domain protein  44.24 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  45.99 
 
 		 303 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  43.06 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  44.36 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  42.22 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  40.89 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  40.81 
 
 		 299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  42.55 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 282 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  40.78 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  41.97 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  42.12 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  43.36 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  44.89 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  40.77 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  42.08 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  40.55 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  39.44 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2467  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 285 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  42.49 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  43.53 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  44 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3280  helix-turn-helix domain protein  39.37 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  42.39 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  43.63 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  43.56 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  43.48 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  40.29 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 295 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  33.45 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  43.12 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1487  XRE family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.414464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2624  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  38.73 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 		 287 aa  151  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  41.11 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  37.87 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2287  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  41.28 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  37.15 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  40.15 
 
 		 278 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  39.86 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.93 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 278 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  42.7 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>