124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4085 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  94.81 
 
 
460 aa  754    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  100 
 
 
489 aa  956    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  49.48 
 
 
445 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  46.29 
 
 
438 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  46.29 
 
 
438 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  47.78 
 
 
442 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  45.43 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  44.62 
 
 
434 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  43.01 
 
 
446 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.73 
 
 
443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  39.11 
 
 
445 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  40.05 
 
 
444 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  35.06 
 
 
440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  39.75 
 
 
464 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  38.41 
 
 
438 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.88 
 
 
446 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  34.85 
 
 
447 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  34.62 
 
 
447 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  38.27 
 
 
444 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  37.14 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  34.56 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  37.5 
 
 
447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  42.01 
 
 
445 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  38.35 
 
 
446 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  33.49 
 
 
443 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  33.86 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  29.75 
 
 
424 aa  153  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.03 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.39 
 
 
419 aa  119  9e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  30.58 
 
 
419 aa  108  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  22.44 
 
 
419 aa  99  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0090  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.85 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  31.65 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.5 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.31 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  24.48 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  29.3 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.78 
 
 
465 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  43 
 
 
307 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  33.11 
 
 
339 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.1 
 
 
453 aa  60.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6591  ferric reductase domain-containing protein  25.87 
 
 
481 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.298176  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2328  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.67 
 
 
465 aa  60.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  30.3 
 
 
400 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.3 
 
 
400 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  20.56 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.95 
 
 
340 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  28.93 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  41.46 
 
 
496 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  25.96 
 
 
450 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
481 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.42 
 
 
447 aa  57.4  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.78 
 
 
585 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  32.5 
 
 
243 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.33 
 
 
399 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  26.05 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0392  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.78 
 
 
469 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.497011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  27.13 
 
 
456 aa  54.3  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000201002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  25.69 
 
 
445 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0901  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.76 
 
 
261 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46928  ferric reductase 2  34.07 
 
 
656 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000397828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.24 
 
 
261 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.6 
 
 
684 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  34.35 
 
 
250 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  32.31 
 
 
339 aa  48.5  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28.93 
 
 
399 aa  48.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.9 
 
 
232 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3391  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.15 
 
 
242 aa  47.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00300696  normal  0.0908673 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2459  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.9 
 
 
352 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109529  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.8 
 
 
684 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.65 
 
 
669 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.78 
 
 
337 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.65 
 
 
234 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.15 
 
 
354 aa  47.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  31.09 
 
 
248 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.26 
 
 
354 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  35.16 
 
 
353 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  29.11 
 
 
627 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00950  metalloreductase, putative  30.05 
 
 
715 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  28.44 
 
 
338 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1267  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.68 
 
 
350 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.41 
 
 
264 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2966  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.67 
 
 
354 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998683  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  28.57 
 
 
393 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.1 
 
 
681 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2603  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  32 
 
 
286 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30 
 
 
687 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.12 
 
 
1138 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.08 
 
 
340 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  37.21 
 
 
326 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  31.9 
 
 
339 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2489  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.45 
 
 
328 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.08 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.57 
 
 
350 aa  45.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  31.78 
 
 
321 aa  45.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.08 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.04 
 
 
351 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54982  ferric reductase  28.06 
 
 
746 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  26.9 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  27.46 
 
 
350 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>