More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0194 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  498  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  99.16 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  86.5 
 
 		 239 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.84 
 
 		 240 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  78.99 
 
 		 234 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  83.2 
 
 		 252 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  82.85 
 
 		 239 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  76.23 
 
 		 240 aa  357  7e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  75.51 
 
 		 241 aa  350  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  61 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  56.3 
 
 		 239 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8578  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.97 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0565107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3564  two component transcriptional regulator  55.46 
 
 		 230 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153344  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0735  two component transcriptional regulator  57.14 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  50.62 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  49.38 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 234 aa  218  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.38 
 
 		 234 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  47.56 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  46.5 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0880  two component transcriptional regulator  54.74 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220279 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3138  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.29 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  44.81 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  48.95 
 
 		 236 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  46.53 
 
 		 239 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  46.58 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  44.73 
 
 		 240 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.93 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2354  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.402981 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  45.57 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.4 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.83 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  44.08 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  45.57 
 
 		 240 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  48.54 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  45.57 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 232 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 232 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  45.15 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 228 aa  194  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  45.15 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  43.72 
 
 		 227 aa  194  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.13 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  44.26 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  44.3 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  43.46 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  47.08 
 
 		 243 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  43.46 
 
 		 245 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  44.02 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  45.15 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  45.15 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.75 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  44.3 
 
 		 239 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  43.53 
 
 		 227 aa  191  6e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2395  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1333  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00265076  decreased coverage  0.0000710625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1253  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.512472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1980  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0224779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2352  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3325  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000316731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1853  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00101518  hitchhiker  0.0000149756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 231 aa  191  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1926  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0250147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1485  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.021777  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2507  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.734124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5249  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204246  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2094  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6141  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1938  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1962  osmolarity response regulator  45.76 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187967  normal  0.0634815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  43.1 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  47.21 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  44.12 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1879  osmolarity response regulator  44.86 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.276509  normal  0.342548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2307  osmolarity response regulator  44.86 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0713504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  43.88 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 227 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  45.15 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  45.57 
 
 		 243 aa  189  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1003  osmolarity response regulator  44.44 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0710839  normal  0.39184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>