171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1153 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1153  thiamine biosynthesis protein ThiS  100 
 
 		 68 aa  131  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3887  thiamine biosynthesis protein ThiS  50 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2567  thiamine biosynthesis protein ThiS  51.56 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.823918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2127  thiamine-biosynthesis protein ThiS  49.25 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3290  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  46.97 
 
 		 331 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2098  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.75 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.219145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4278  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0658142  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0536  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1317  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0546  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.639054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0558  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.577012 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1262  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2465  ThiS, thiamine-biosynthesis  46.03 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.928732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2933  ThiS, thiamine-biosynthesis  38.1 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0004662  hitchhiker  3.85019e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1339  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038066 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1773  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.31 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5998  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.03 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.786244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2584  hypothetical protein  42.42 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3429  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.27 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2780  thiamine biosynthesis protein ThiS  66.67 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0685562  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6770  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.53 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4093  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467775  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0838  ThiS, thiamine-biosynthesis  40.3 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1957  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.68 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3034  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.75 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00295138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1268  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0448831  hitchhiker  0.00213488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2501  thiamine biosynthesis protein ThiS  46.97 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000495099 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0988  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0800067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0709  sulfur carrier protein ThiS  49.06 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367637  normal  0.0347852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0196  sulfur carrier protein ThiS  47.17 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6223  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4701  bifunctional sulfur carrier protein/thiazole synthase protein  51.61 
 
 		 374 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468322  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2638  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.12 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7517  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.06 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12799  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  50.79 
 
 		 64 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.133934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0913  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.62 
 
 		 64 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3289  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.31 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3747  thiamine biosynthesis protein ThiS  48.44 
 
 		 65 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2892  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.98 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.502448  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2782  putative thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1043  ThiS, thiamine-biosynthesis  39.68 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0035  thiamine biosynthesis protein ThiS  43.55 
 
 		 73 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2458  thiamine biosynthesis protein ThiS  34.38 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04970  sulfur carrier protein ThiS  47.17 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6397  sulfur carrier protein ThiS  42.86 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002075  sulfur carrier protein ThiS  35.38 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0479  sulfur carrier protein ThiS  47.17 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738565  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2683  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.809629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00363  sulfur carrier protein ThiS  36.92 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3117  thiamine biosynthesis protein ThiS  44.78 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.295456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3433  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.54 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5046  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461936  normal  0.383391 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2522  thiamine biosynthesis protein ThiS  42.19 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1150  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.75 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000104387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2224  thiamine biosynthesis protein ThiS  40 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1915  thiamine biosynthesis protein ThiS  36.92 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0610  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00214937  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02970  thiamine biosynthesis protein ThiS  47.17 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4103  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.16 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.189024  decreased coverage  0.00486776 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3658  thiamine biosynthesis protein ThiS  32.81 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0204  sulfur carrier protein ThiS  36.36 
 
 		 66 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0788  sulfur carrier protein ThiS  42.42 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450844  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3313  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.46 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2165  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.1 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433282  normal  0.219669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0615  thiamine biosynthesis protein ThiS  45.59 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920589  normal  0.197497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2907  thiamine biosynthesis protein ThiS  38.71 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2198  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.3 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3862  ThiS, thiamine-biosynthesis  41.79 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0818304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0239  thiamine biosynthesis sulfur transfer protein  34.33 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.164539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0618  sulfur carrier protein ThiS  43.28 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0589  hypothetical protein  28.12 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.519327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0801  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0697  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0641  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0808  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47601e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0731  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0071  thiamine biosynthesis protein ThiS  31.25 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.290426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0409  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.94 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0838013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4543  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.528402 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0885  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000164722  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2062  sulfur carrier protein ThiS  40.32 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0207  thiamine biosynthesis protein ThiS  39.06 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.549071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4439  sulfur carrier protein ThiS  33.33 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2482  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.32 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.116747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0641  sulfur carrier protein ThiS  40.91 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1984  sulfur carrier protein ThiS  40.32 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2563  thiamine biosynthesis protein ThiS  41.27 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1656  thiamine biosynthesis protein ThiS  42 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0620  thiamine biosynthesis protein ThiS  35.82 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4978  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10421  sulfur carrier protein ThiS  47.27 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4172  sulfur carrier protein ThiS  41.27 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.455905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0774  thiamine biosynthesis protein ThiS  40.62 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.176558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5155  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.404683  normal  0.862246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0360  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.18682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5105  sulfur carrier protein ThiS  41.94 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.205609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0216  thiamine biosynthesis protein ThiS  37.5 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1857  thiamine biosynthesis protein ThiS  29.85 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2465  thiamine biosynthesis protein ThiS  33.96 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.408493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>