More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0044 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  48.84 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  50 
 
 		 173 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  45.74 
 
 		 300 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  49.61 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  46.72 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  44.08 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  46.72 
 
 		 192 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 198 aa  115  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  47.54 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  49.18 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  46.72 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  47.54 
 
 		 219 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  45.9 
 
 		 170 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  45.9 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  42.21 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  48.8 
 
 		 191 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  45.9 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  39.88 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  48.36 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  48.36 
 
 		 188 aa  113  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  47.54 
 
 		 189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  48.8 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  45.53 
 
 		 188 aa  110  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  45.9 
 
 		 193 aa  110  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  48.36 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  42.62 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  42.62 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  45.53 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  45.08 
 
 		 225 aa  107  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  43.7 
 
 		 193 aa  107  5e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  49.18 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  45.9 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  42.15 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  44.54 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  44.26 
 
 		 200 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  37.58 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  40.65 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  40.4 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  41.03 
 
 		 174 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  50.5 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  39.39 
 
 		 305 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  40 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  43.64 
 
 		 171 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 154 aa  90.9  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  43.14 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  43.56 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  36.73 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  41.8 
 
 		 201 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  47.52 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  43.14 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  40 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  44.55 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  43.56 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  43.56 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  41.58 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  35.81 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.62 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  34.09 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  39.22 
 
 		 138 aa  76.6  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 166 aa  76.6  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  36.72 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  37.25 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>