232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1244 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1244  50S ribosomal protein L30P  100 
 
 		 74 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186097  hitchhiker  0.00279952 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0492  50S ribosomal protein L30  47.17 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278097  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0469  50S ribosomal protein L30  45.28 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000219229  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2315  ribosomal protein L30  44.23 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0059609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  45.45 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_434  ribosomal protein L30/L7E  43.4 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00214762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  36.07 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0272  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0343229  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  38.98 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  36.07 
 
 		 62 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 59 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1215  50S ribosomal protein L30  36.67 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1974  50S ribosomal protein L30  36.67 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0435549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1167  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00970814  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1178  50S ribosomal protein L30  36.67 
 
 		 65 aa  52  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.109689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  48.21 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1660  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0512688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  36.84 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  39.62 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  43.64 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  40 
 
 		 59 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  40.35 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  41.07 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1165  ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0238575  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1777  50S ribosomal protein L30P  39.29 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0189891  normal  0.14653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  38.1 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  40 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0737  50S ribosomal protein L30  39.29 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000491198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0949  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 62 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  39.66 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  39.34 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  41.67 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  37.04 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  38.6 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0341  ribosomal protein L30  40 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000260811  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  37.1 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  37.1 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  37.7 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3006  50S ribosomal protein L30  40.38 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.319275  hitchhiker  0.00803225 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0179  50S ribosomal protein L30  43.4 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  40 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>