More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0379 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2886  L-ribulokinase  67.69 
 
 		 556 aa  734    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  100 
 
 		 577 aa  1169    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4715  ribulokinase  61.5 
 
 		 556 aa  659    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06940  L-ribulokinase  73.98 
 
 		 579 aa  808    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0749  L-ribulokinase  61.93 
 
 		 572 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1861  ribulokinase  74.87 
 
 		 554 aa  826    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  88.01 
 
 		 585 aa  1001    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0871  ribulokinase  65.36 
 
 		 564 aa  687    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6219  ribulokinase  64.16 
 
 		 551 aa  672    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0380  ribulokinase  70.93 
 
 		 567 aa  742    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.526871  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3274  ribulokinase  69.75 
 
 		 598 aa  728    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187785  normal  0.0296673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  54.35 
 
 		 562 aa  605  9.999999999999999e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  52.06 
 
 		 556 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  54.32 
 
 		 564 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  54.45 
 
 		 564 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  36.81 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0589  ribulokinase  36.81 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1748  L-ribulokinase  39.93 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  42.48 
 
 		 562 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2057  carbohydrate kinase FGGY  39.55 
 
 		 517 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.795187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1383  carbohydrate kinase FGGY  39.67 
 
 		 553 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.396144  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1927  ribulokinase  33.96 
 
 		 536 aa  320  5e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2398  ribulokinase  36.66 
 
 		 554 aa  283  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2729  ribulokinase  33.92 
 
 		 557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0860748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1997  ribulokinase  34.83 
 
 		 557 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00226612  unclonable  0.0000285081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1977  ribulokinase  34.83 
 
 		 557 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489271  normal  0.124359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2064  ribulokinase  34.65 
 
 		 557 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000583792  hitchhiker  0.00000400193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3994  ribulokinase  36.01 
 
 		 547 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.026407  normal  0.515054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3201  ribulokinase  35.68 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.995888 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0114  ribulokinase  35.09 
 
 		 569 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0114  ribulokinase  35.09 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.728567  normal  0.199883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1239  L-ribulokinase  35.07 
 
 		 544 aa  256  6e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.711611  normal  0.13078 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00065  ribulokinase  34.36 
 
 		 566 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3594  ribulokinase  34.36 
 
 		 566 aa  256  8e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560965  unclonable  0.0000000207418 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00064  hypothetical protein  34.36 
 
 		 566 aa  256  8e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0055  ribulokinase  34 
 
 		 566 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3536  L-ribulokinase  34.54 
 
 		 566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0110  ribulokinase  34.91 
 
 		 569 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.407492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0067  ribulokinase  34 
 
 		 566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0109  ribulokinase  34.73 
 
 		 569 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.526121 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0068  ribulokinase  33.82 
 
 		 566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1119  ribulokinase  34.05 
 
 		 563 aa  253  6e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0065  ribulokinase  33.82 
 
 		 566 aa  253  8.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.703841  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0065  ribulokinase  33.82 
 
 		 566 aa  252  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.268824  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0772  ribulokinase  35.62 
 
 		 555 aa  250  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289465  normal  0.0721691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0107  ribulokinase  34.55 
 
 		 569 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0610  ribulokinase  33.7 
 
 		 569 aa  249  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59168  normal  0.0130922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2138  ribulokinase  32.85 
 
 		 557 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000886858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2328  ribulokinase  34.12 
 
 		 561 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.717487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2150  ribulokinase  33.21 
 
 		 561 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2028  ribulokinase  33.45 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2068  ribulokinase  32.97 
 
 		 557 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000109649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1913  ribulokinase  32.97 
 
 		 563 aa  233  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2244  ribulokinase  33.21 
 
 		 561 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000378483 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0322  ribulokinase  33.1 
 
 		 529 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2000  ribulokinase  31.5 
 
 		 567 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1886  ribulokinase  31.5 
 
 		 567 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2260  ribulokinase  31.32 
 
 		 567 aa  209  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  32.14 
 
 		 524 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  31.33 
 
 		 528 aa  180  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  32.16 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  32.89 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  30.21 
 
 		 545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  32.19 
 
 		 545 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  29.73 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  29.73 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  29.73 
 
 		 545 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  31.74 
 
 		 534 aa  168  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  31.69 
 
 		 538 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  31.74 
 
 		 534 aa  167  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  29.72 
 
 		 501 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  30.69 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  28.21 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  33.39 
 
 		 547 aa  160  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  30.81 
 
 		 523 aa  160  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  31.36 
 
 		 482 aa  159  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  29.6 
 
 		 547 aa  156  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  30.62 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  30.62 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.63 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  29.63 
 
 		 438 aa  153  8.999999999999999e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  30.7 
 
 		 543 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  31.02 
 
 		 544 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  30.17 
 
 		 529 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  30.71 
 
 		 544 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  30.3 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  29.78 
 
 		 527 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  30.88 
 
 		 526 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  31.42 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  30.58 
 
 		 549 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  29.51 
 
 		 489 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  30.17 
 
 		 505 aa  140  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  30.12 
 
 		 506 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  29.48 
 
 		 527 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  26.25 
 
 		 500 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.77 
 
 		 506 aa  130  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  30.4 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86603  possible ribitol kinase or glycerol kinase  26.76 
 
 		 758 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  26.77 
 
 		 510 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  27.5 
 
 		 544 aa  127  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>