More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0223 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  909    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  65.14 
 
 		 438 aa  599  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  63.87 
 
 		 439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  61.99 
 
 		 442 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  62.41 
 
 		 449 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  60.7 
 
 		 435 aa  554  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  59.53 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.81 
 
 		 444 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.24 
 
 		 425 aa  511  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.81 
 
 		 441 aa  471  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.75 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  42.15 
 
 		 451 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  41.88 
 
 		 449 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  41.45 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  41.92 
 
 		 450 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  41.92 
 
 		 450 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  41.69 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  41.69 
 
 		 450 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  41.69 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  41.69 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  42.42 
 
 		 448 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  42.42 
 
 		 448 aa  342  8e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.37 
 
 		 451 aa  342  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  41.45 
 
 		 450 aa  341  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  41.45 
 
 		 450 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  41.45 
 
 		 450 aa  340  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  41.45 
 
 		 450 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.71 
 
 		 449 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  40.75 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.95 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  37.44 
 
 		 454 aa  322  6e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.09 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.19 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.38 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  41.05 
 
 		 446 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.97 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  36.64 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.1 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  39.33 
 
 		 458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.48 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  39.68 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  36.71 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.25 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.82 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  35.03 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  36.83 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  36.66 
 
 		 434 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.26 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.41 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.2 
 
 		 456 aa  296  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.09 
 
 		 471 aa  296  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  37.35 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.53 
 
 		 438 aa  293  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.19 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  38.69 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.81 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.08 
 
 		 438 aa  286  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  38.96 
 
 		 439 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.48 
 
 		 442 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.52 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  36.11 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0459  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.62 
 
 		 453 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.240377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  34.4 
 
 		 440 aa  269  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.89 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  32.16 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  34.25 
 
 		 413 aa  255  9e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  33.87 
 
 		 416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1749  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35 
 
 		 451 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000349639  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.06 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.56 
 
 		 416 aa  246  8e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.53 
 
 		 411 aa  245  9e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34 
 
 		 420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.18 
 
 		 434 aa  243  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.5 
 
 		 421 aa  243  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.78 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.94 
 
 		 420 aa  240  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  32.86 
 
 		 411 aa  240  4e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0217  MiaB family tRNA modification protein  33.57 
 
 		 412 aa  239  1e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.18 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  35.43 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0785  MiaB family tRNA modification protein  35.22 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.84 
 
 		 419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.73 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.26 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1402  RNA modification enzyme, MiaB family  32.61 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.42 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.67 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  33.58 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.68 
 
 		 427 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.76 
 
 		 425 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.97 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.84 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.91 
 
 		 441 aa  227  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.84 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.15 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  34.41 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  34.41 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0298  RNA modification enzyme, MiaB family  31.02 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.56 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>