More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0217 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  87.59 
 
 		 411 aa  752    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0217  MiaB family tRNA modification protein  100 
 
 		 412 aa  839    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  63.83 
 
 		 408 aa  539  9.999999999999999e-153  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.84 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0785  MiaB family tRNA modification protein  51.3 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.26 
 
 		 420 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.31 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.77 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  48.08 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  48.08 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  48.85 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.77 
 
 		 416 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.67 
 
 		 411 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.17 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.82 
 
 		 423 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2775  2-methylthioadenine synthetase  45 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.254506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.5 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.47 
 
 		 420 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.48 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4070  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.22 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.81 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3747  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.8 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3390  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.8 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.15 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  44.02 
 
 		 427 aa  364  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.58 
 
 		 420 aa  362  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4197  hypothetical protein  47.31 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0515  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.13 
 
 		 443 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.481565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.37 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  43.37 
 
 		 425 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.19 
 
 		 425 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.93 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.852601 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.4 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0373  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.99 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215959  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.36 
 
 		 410 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2929  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.86 
 
 		 419 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0184  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.65 
 
 		 412 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2721  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.87 
 
 		 410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.61 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2948  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.63 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  hitchhiker  0.001764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.2 
 
 		 437 aa  329  6e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5336  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.52 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3655  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.76 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378988  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1401  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.1 
 
 		 398 aa  297  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.14892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2731  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.93 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.549128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  35.75 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  34.04 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.86 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.99 
 
 		 429 aa  250  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  34.81 
 
 		 450 aa  248  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  36.96 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  36.96 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  36.96 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  36.96 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  36.96 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  36.96 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  36.96 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  36.96 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  37.16 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  36.68 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.6 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.58 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.52 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  33.18 
 
 		 448 aa  239  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  33.57 
 
 		 441 aa  239  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  33.49 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  33.49 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  32.95 
 
 		 436 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.94 
 
 		 449 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.76 
 
 		 441 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.56 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  33.25 
 
 		 437 aa  232  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.52 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.52 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  32.94 
 
 		 458 aa  230  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  32.08 
 
 		 434 aa  229  9e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  35.45 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.97 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  36.05 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.83 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.38 
 
 		 431 aa  223  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.58 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.37 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 		 439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.67 
 
 		 438 aa  222  9e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  32.9 
 
 		 435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.62 
 
 		 430 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  32.07 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0626  RNA modification enzyme, MiaB family  32.4 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.196268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.59 
 
 		 451 aa  216  8e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.39 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  32.92 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.94 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.49 
 
 		 450 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.02 
 
 		 466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  31.19 
 
 		 452 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  33.08 
 
 		 458 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.04 
 
 		 449 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1402  RNA modification enzyme, MiaB family  31.33 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  31.05 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>