More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0209 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  65.31 
 
 
495 aa  661    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  64.95 
 
 
499 aa  659    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 
499 aa  658    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 
499 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 
499 aa  660    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 
499 aa  660    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 
494 aa  693    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 
499 aa  660    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  64.95 
 
 
499 aa  659    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 
499 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 
515 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 
515 aa  655    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 
499 aa  661    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  66.25 
 
 
494 aa  678    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
495 aa  999    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 
499 aa  653    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  64.33 
 
 
499 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
489 aa  600  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 
488 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 
491 aa  593  1e-168  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
497 aa  590  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0280  lysyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
504 aa  589  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0337786  hitchhiker  0.000160762 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 
493 aa  586  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  57.64 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
494 aa  581  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  59.76 
 
 
489 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 
496 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  58.16 
 
 
508 aa  569  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 
499 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0406  lysyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
495 aa  568  1e-160  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.751997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  56.59 
 
 
490 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
499 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0190  lysyl-tRNA synthetase (class II)  56.85 
 
 
496 aa  561  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
489 aa  558  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0628  lysyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 
631 aa  555  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.350218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  56.56 
 
 
503 aa  550  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 
573 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  55.85 
 
 
509 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 
573 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 
561 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 
573 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 
504 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  53.36 
 
 
499 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1118  lysyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
505 aa  537  1e-151  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
494 aa  526  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
491 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  52.63 
 
 
491 aa  522  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2781  lysyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
501 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  52.56 
 
 
499 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 
492 aa  519  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17441  lysyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 
503 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.553165  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2467  lysyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 
501 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  51.63 
 
 
492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl030  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 
499 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1195  lysyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
494 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 
492 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0836  lysyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  54.34 
 
 
485 aa  513  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20701  lysyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 
513 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
507 aa  512  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  50.81 
 
 
498 aa  508  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 
508 aa  508  1e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0600  lysyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
508 aa  508  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.834751  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0069  lysyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
493 aa  508  9.999999999999999e-143  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
512 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
505 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 
499 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 
502 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
494 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 
502 aa  502  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
503 aa  504  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
509 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0007  lysyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 
497 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  52.34 
 
 
501 aa  503  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 
503 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 
504 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 
502 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50879  predicted protein  50.19 
 
 
607 aa  499  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0733722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
502 aa  499  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 
511 aa  501  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 
498 aa  499  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  49.8 
 
 
505 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
505 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
506 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  50.82 
 
 
647 aa  498  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
505 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
505 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  50.81 
 
 
501 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
505 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18101  lysyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
512 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1711  lysyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 
512 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 
507 aa  495  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
505 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  49.8 
 
 
505 aa  497  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 
506 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
501 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 
505 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 
484 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>