More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2037 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 165 aa  322  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  100 
 
 		 165 aa  322  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  99.39 
 
 		 165 aa  320  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  87.5 
 
 		 164 aa  266  7e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  55.26 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1268  50S ribosomal protein L15  52.6 
 
 		 171 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.11537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  52.05 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  50.29 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  51.95 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0516  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.061752  unclonable  0.0000000000147617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0346  50S ribosomal protein L15  54.86 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  51.66 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  52.26 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  53.42 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  55.48 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  49.68 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  53.38 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  56.43 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 143 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  53.79 
 
 		 143 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000022076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  50.35 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3049  50S ribosomal protein L15  57.86 
 
 		 144 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0903585  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  49.35 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  54.23 
 
 		 143 aa  131  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0295  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000417234  normal  0.0653765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0286  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  57.14 
 
 		 144 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  49.03 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  53.69 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00749  50S ribosomal protein L15  55.17 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001723  LSU ribosomal protein L15p (L27Ae)  55.17 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000210638  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0268  50S ribosomal protein L15  56.43 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.366477  normal  0.0148786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  56.43 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  56.43 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  48.41 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  53.15 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  56.43 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  56.43 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2155  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000156798  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  56.43 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  47.95 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0339  50S ribosomal protein L15  53.15 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.003773  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0342  ribosomal protein L15  50 
 
 		 142 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  47.06 
 
 		 169 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 144 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1927  50S ribosomal protein L15  53.02 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2150  ribosomal protein L15  51.41 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0266224  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  49.35 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  53.47 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  51.02 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0786  ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 143 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00496718  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  54.29 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0620  ribosomal protein L15  53.1 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.527453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0839  50S ribosomal protein L15  52.82 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0717  50S ribosomal protein L15  44.94 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0686149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  47.26 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000785215  unclonable  0.00000000000230267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0232  50S ribosomal protein L15  54.55 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000110741  unclonable  0.00000829235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2755  ribosomal protein L15  46.71 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0991821  normal  0.351849 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0347  ribosomal protein L15  47.55 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0265978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0298  50S ribosomal protein L15P  49.3 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000286334  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0177  50S ribosomal protein L15  55.24 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150023  hitchhiker  0.000371203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0738  ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  50.68 
 
 		 176 aa  124  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 147 aa  124  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3505  ribosomal protein L15  54.48 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000855163  hitchhiker  0.0000000902196 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  51.37 
 
 		 146 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  54.05 
 
 		 172 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  53.85 
 
 		 144 aa  124  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3890  50S ribosomal protein L15  53.52 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000709059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0424  50S ribosomal protein L15P  52.45 
 
 		 144 aa  123  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41995  normal  0.220664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03152  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0101402  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0412  ribosomal protein L15  51.75 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000322433  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3784  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000013362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3596  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0211093  normal  0.0248646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3725  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0844463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3690  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0494  50S ribosomal protein L15P  54.93 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4624  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00028401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3686  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3617  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3617  50S ribosomal protein L15  52.45 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00159971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>