4134 genes were found for organism Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Smal_0001  CDS  NC_011071  215  1546  1332  chromosomal replication initiation protein  YP_002026389  normal  normal  0.351926  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0002  CDS  NC_011071  1823  2923  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_002026390  normal  normal  0.366013  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0003  CDS  NC_011071  3921  5015  1095  recombination protein F  YP_002026391  normal  normal  0.0323054  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0004  CDS  NC_011071  5128  7587  2460  DNA gyrase subunit B  YP_002026392  normal  normal  0.0307059  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0005  CDS  NC_011071  7655  8500  846  Abortive infection protein  YP_002026393  normal  normal  0.0159968  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0006  CDS  NC_011071  8572  9378  807  peptidase M48 Ste24p  YP_002026394  normal  hitchhiker  0.00889597  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0007  CDS  NC_011071  9511  10698  1188  TPR repeat-containing protein  YP_002026395  normal  normal  0.0101354  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0008  CDS  NC_011071  10842  11510  669  TonB family protein  YP_002026396  normal  hitchhiker  0.00440942  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0009  CDS  NC_011071  11606  12367  762  MotA/TolQ/ExbB proton channel  YP_002026397  normal  hitchhiker  0.00486785  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0010  CDS  NC_011071  12428  12853  426  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_002026398  normal  hitchhiker  0.0041719  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0011  CDS  NC_011071  12857  13270  414  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  YP_002026399  normal  hitchhiker  0.00423536  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0012  CDS  NC_011071  13421  14881  1461  phospholipase D/Transphosphatidylase  YP_002026400  normal  hitchhiker  0.00321981  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0013  CDS  NC_011071  14922  15191  270  hypothetical protein  YP_002026401  normal  hitchhiker  0.00182291  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0014  CDS  NC_011071  15201  15944  744  pyridoxine 5'-phosphate synthase  YP_002026402  normal  hitchhiker  0.00104614  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0015  CDS  NC_011071  16088  17179  1092  Radical SAM domain protein  YP_002026403  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0016  CDS  NC_011071  17350  20574  3225  YD repeat protein  YP_002026404  normal  0.15112  hitchhiker  4.18837e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0017  CDS  NC_011071  20769  22985  2217  YD repeat protein  YP_002026405  normal  0.215545  hitchhiker  2.636e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0018  CDS  NC_011071  22991  23173  183  hypothetical protein  YP_002026406  normal  0.426513  hitchhiker  1.96989e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0019  CDS  NC_011071  23234  23941  708  hypothetical protein  YP_002026407  normal  hitchhiker  2.80504e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0020  CDS  NC_011071  24049  25065  1017  fructose-1,6-bisphosphatase  YP_002026408  normal  hitchhiker  6.87853e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0021  CDS  NC_011071  25398  26600  1203  aromatic amino acid aminotransferase  YP_002026409  normal  hitchhiker  1.17324e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0022  CDS  NC_011071  26772  28865  2094  TonB-dependent receptor  YP_002026410  normal  hitchhiker  2.55766e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0023  CDS  NC_011071  29094  29438  345  hypothetical protein  YP_002026411  normal  hitchhiker  5.94941e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0024  CDS  NC_011071  29586  29984  399  hypothetical protein  YP_002026412  normal  hitchhiker  4.59054e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0025  CDS  NC_011071  30139  31044  906  Ku protein  YP_002026413  normal  0.520285  hitchhiker  7.87139e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0026  CDS  NC_011071  31048  33525  2478  DNA ligase D  YP_002026414  normal  0.282762  hitchhiker  3.59668e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0027  CDS  NC_011071  33597  33989  393  hypothetical protein  YP_002026415  normal  0.27905  hitchhiker  8.30846e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0028  CDS  NC_011071  34147  35175  1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  YP_002026416  normal  0.0233433  decreased coverage  1.33046e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0029  CDS  NC_011071  35272  35910  639  2-dehydro-3-deoxyphosphogluconate aldolase/4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase  YP_002026417  normal  0.156241  hitchhiker  7.60103e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0030  CDS  NC_011071  36026  36682  657  cysteine dioxygenase type I  YP_002026418  normal  0.174778  hitchhiker  7.9419e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0031  CDS  NC_011071  36856  37911  1056  transcriptional regulator, LacI family  YP_002026419  normal  0.532737  hitchhiker  2.992e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0032  CDS  NC_011071  38010  38903  894  phenylalanine 4-monooxygenase  YP_002026420  normal  0.686174  hitchhiker  2.92031e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0033  CDS  NC_011071  39029  39514  486  transcriptional regulator, AsnC family  YP_002026421  normal  hitchhiker  2.10116e-07  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0034  CDS  NC_011071  39662  40405  744  hypothetical protein  YP_002026422  normal  0.557948  hitchhiker  4.53401e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0035  CDS  NC_011071  40452  41444  993  Patatin  YP_002026423  normal  0.488757  hitchhiker  1.89708e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0036  CDS  NC_011071  41729  42745  1017  protein of unknown function DUF124  YP_002026424  normal  0.0214903  hitchhiker  2.02128e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0037  CDS  NC_011071  42905  45178  2274  TonB-dependent receptor  YP_002026425  normal  0.22969  hitchhiker  4.67623e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0038  CDS  NC_011071  45291  46130  840  Acid phosphatase  YP_002026426  normal  0.17079  hitchhiker  0.000164539  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0039  CDS  NC_011071  46392  47270  879  hypothetical protein  YP_002026427  normal  0.104676  hitchhiker  0.000427768  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0040  CDS  NC_011071  47282  48484  1203  hypothetical protein  YP_002026428  normal  0.13813  hitchhiker  0.00125865  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0041  CDS  NC_011071  48628  49479  852  ABC transporter related  YP_002026429  normal  0.202842  hitchhiker  0.00435471  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0042  CDS  NC_011071  49601  50803  1203  fatty acid desaturase  YP_002026430  normal  hitchhiker  0.00931019  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0043  CDS  NC_011071  50800  51132  333  hypothetical protein  YP_002026431  normal  normal  0.0382289  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0044  CDS  NC_011071  51363  52145  783  hypothetical protein  YP_002026432  normal  normal  0.0424272  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0045  CDS  NC_011071  52216  53028  813  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  YP_002026433  normal  0.890377  normal  0.0669728  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0046  CDS  NC_011071  53134  54738  1605  glucan biosynthesis protein D  YP_002026434  normal  normal  0.11724  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0047  CDS  NC_011071  55261  55881  621  thymidine kinase  YP_002026435  normal  0.126772  normal  0.139333  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0048  CDS  NC_011071  55891  56619  729  hypothetical protein  YP_002026436  normal  0.0235456  normal  0.207526  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0049  CDS  NC_011071  56655  57383  729  Sel1 domain protein repeat-containing protein  YP_002026437  normal  0.0193293  normal  0.393755  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0050  CDS  NC_011071  57483  59459  1977  ATP-dependent DNA helicase Rep  YP_002026438  normal  0.0153579  normal  0.502615  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0051  CDS  NC_011071  59721  60248  528  acetyltransferase  YP_002026439  normal  0.106469  normal  0.472736  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0052  CDS  NC_011071  60347  60997  651  protein of unknown function DUF480  YP_002026440  normal  0.102804  normal  0.491736  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0053  CDS  NC_011071  61099  62022  924  5'-nucleotidase, lipoprotein e(P4) family  YP_002026441  normal  0.127569  normal  0.529666  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0054  CDS  NC_011071  62019  62744  726  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  YP_002026442  normal  0.668833  normal  0.533949  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0055  CDS  NC_011071  63143  64096  954  hypothetical protein  YP_002026443  normal  normal  0.918451  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0056  CDS  NC_011071  64096  66732  2637  glycerol-3-phosphate acyltransferase  YP_002026444  normal  normal  0.753755  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0057  CDS  NC_011071  66823  67026  204  hypothetical protein  YP_002026445  normal  normal  0.982813  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0058  CDS  NC_011071  67117  68013  897  C32 tRNA thiolase  YP_002026446  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0059  CDS  NC_011071  68050  68955  906  recombination associated protein  YP_002026447  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0060  CDS  NC_011071  69015  69794  780  protein of unknown function DUF45  YP_002026448  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0061  CDS  NC_011071  70087  70953  867  hypothetical protein  YP_002026449  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0062  CDS  NC_011071  71106  73529  2424  multi-sensor hybrid histidine kinase  YP_002026450  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0063  CDS  NC_011071  73515  74960  1446  glutamate synthase subunit beta  YP_002026451  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0064  CDS  NC_011071  75046  79500  4455  glutamate synthase subunit alpha  YP_002026452  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0065  CDS  NC_011071  79676  80065  390  hypothetical protein  YP_002026453  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0066  CDS  NC_011071  80177  81235  1059  hypothetical protein  YP_002026454  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0067  CDS  NC_011071  81223  81531  309  hypothetical protein  YP_002026455  normal  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0068  CDS  NC_011071  81748  82854  1107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  YP_002026456  normal  0.521735  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0069  CDS  NC_011071  82974  84389  1416  hypothetical protein  YP_002026457  normal  0.70307  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0070  CDS  NC_011071  84390  85193  804  hypothetical protein  YP_002026458  normal  0.998862  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0071  CDS  NC_011071  85128  86249  1122  beta-lactamase  YP_002026459  normal  0.902729  normal  0.844307  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0072  CDS  NC_011071  86394  87341  948  transcriptional regulator, AraC family  YP_002026460  normal  normal  0.582796  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0073  CDS  NC_011071  87475  87861  387  hypothetical protein  YP_002026461  normal  0.540037  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0074  CDS  NC_011071  87851  89071  1221  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002026462  normal  0.220484  normal  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0075  CDS  NC_011071  89089  91344  2256  TonB-dependent receptor  YP_002026463  normal  0.612436  normal  0.5792  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0076  CDS  NC_011071  91452  91838  387  transcriptional repressor, CopY family  YP_002026464  normal  0.726818  normal  0.662911  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0077  CDS  NC_011071  91842  93836  1995  peptidase M56 BlaR1  YP_002026465  normal  normal  0.559375  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0078  CDS  NC_011071  93930  94244  315  lipoprotein, putative  YP_002026466  normal  normal  0.473442  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0079  CDS  NC_011071  94311  95333  1023  hypothetical protein  YP_002026467  normal  normal  0.418653  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0080  CDS  NC_011071  95330  97819  2490  DEAD/DEAH box helicase domain protein  YP_002026468  normal  normal  0.412671  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0081  CDS  NC_011071  98032  98550  519  hypothetical protein  YP_002026469  normal  normal  0.178804  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0082  CDS  NC_011071  98590  99264  675  hypothetical protein  YP_002026470  normal  normal  0.180703  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0083  CDS  NC_011071  99364  101172  1809  hypothetical protein  YP_002026471  normal  normal  0.172462  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0084  CDS  NC_011071  101169  103355  2187  hypothetical protein  YP_002026472  normal  normal  0.186281  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0085  CDS  NC_011071  103352  104473  1122  hypothetical protein  YP_002026473  normal  0.160108  normal  0.101307  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0086  CDS  NC_011071  104470  105366  897  protein of unknown function DUF58  YP_002026474  normal  0.153516  normal  0.0632534  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0087  CDS  NC_011071  105374  106357  984  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  YP_002026475  normal  0.299862  normal  0.0406879  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0088  CDS  NC_011071  106374  107081  708  hypothetical protein  YP_002026476  normal  0.235222  normal  0.0227484  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0089  CDS  NC_011071  107081  108415  1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_002026477  normal  0.237903  normal  0.0283607  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0090  CDS  NC_011071  108437  110071  1635  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_002026478  normal  0.42092  normal  0.0324493  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0091  CDS  NC_011071  110099  111730  1632  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  YP_002026479  normal  0.196627  normal  0.0324493  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0092  CDS  NC_011071  112416  113030  615  protein of unknown function DUF938  YP_002026480  normal  0.251165  normal  0.0214526  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0093  CDS  NC_011071  113031  114353  1323  HipA N-terminal domain protein  YP_002026481  normal  0.0648821  normal  0.0261273  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0094  CDS  NC_011071  114357  114614  258  transcriptional regulator, XRE family  YP_002026482  normal  0.850445  normal  0.0181777  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0095  CDS  NC_011071  114772  118458  3687  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  YP_002026483  normal  0.602888  normal  0.037997  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0096  CDS  NC_011071  118628  119263  636  hypothetical protein  YP_002026484  normal  0.059299  decreased coverage  0.00703459  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0097  CDS  NC_011071  119856  121340  1485  AAA ATPase central domain protein  YP_002026485  normal  0.0174447  decreased coverage  0.00506367  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0098  CDS  NC_011071  121464  122093  630  partition protein  YP_002026486  normal  0.10243  normal  0.0389744  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0099  CDS  NC_011071  122131  122607  477  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  YP_002026487  normal  0.239035  normal  0.0377722  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Smal_0100  CDS  NC_011071  122612  123229  618  YceI family protein  YP_002026488  normal  0.242107  normal  0.0242247  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 42    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>