30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0078 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  100 
 
 
104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  42.27 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  37.86 
 
 
101 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  35.19 
 
 
110 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  37.11 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  35.35 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  30.61 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  36.14 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  32.98 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  30.63 
 
 
111 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  33 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  36.36 
 
 
107 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  33.85 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  31.58 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  33.85 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  36.71 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  36.92 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  42.65 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  30.34 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  32.31 
 
 
111 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  31.58 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  25.71 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  31.17 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2357  hypothetical protein  32.43 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  32.97 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  36.92 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1230  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119331  normal  0.387929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>