More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0401 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0401  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
290 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0460  enoyl-CoA hydratase  97.59 
 
 
290 aa  590  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00068  enoyl-CoA hydratase  65.71 
 
 
289 aa  391  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.279285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1830  enoyl-CoA hydratase  64.77 
 
 
289 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0083  enoyl-CoA hydratase  38.89 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.293903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2672  enoyl-CoA hydratase  39.93 
 
 
300 aa  198  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2657  enoyl-CoA hydratase  43.4 
 
 
296 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000176785  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5972  enoyl-CoA hydratase  34.49 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.629143  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4743  enoyl-CoA hydratase  35.56 
 
 
292 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3555  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
287 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3965  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
287 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224001  normal  0.0275416 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2572  enoyl-CoA hydratase  34.86 
 
 
287 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3463  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 
287 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5121  enoyl-CoA hydratase  34.75 
 
 
287 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5286  enoyl-CoA hydratase  34.51 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5455  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1151  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0246  enoyl-CoA hydratase  41.43 
 
 
316 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.107145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5278  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
292 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2182  enoyl-CoA hydratase  33.95 
 
 
289 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1841  short chain enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
150 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  33.11 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  33.1 
 
 
262 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.13 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0817  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  28.92 
 
 
737 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1547  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  32.26 
 
 
637 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000330184  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08370  short chain enoyl-CoA hydratase  34.01 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0645146  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
797 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.55 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3572  enoyl-CoA hydratase  32.93 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.53 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2296  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.82 
 
 
733 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498379  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.08 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.16 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.85 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  38.14 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  33.81 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  29.7 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  32.41 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  29.27 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3553  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  40.45 
 
 
699 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933937  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0871  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.82 
 
 
733 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274544  normal  0.255426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2196  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  31.82 
 
 
733 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0357  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.33 
 
 
707 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1206  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.65 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  30 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1813  short chain enoyl-CoA hydratase  31.65 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1746  enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 
699 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0570089 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.62 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.760291  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  25.7 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2226  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  39.33 
 
 
697 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0438642  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  32.17 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  26.49 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  26.49 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  26.49 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  26.49 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  39.29 
 
 
692 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.53 
 
 
258 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1088  enoyl-CoA hydratase  31.1 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.571609  normal  0.014432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.85 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.76 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.21 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.94 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4238  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  38.2 
 
 
699 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.87479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.09 
 
 
695 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7074  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.2 
 
 
697 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.663612  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0793  fatty oxidation complex, alpha subunit  26.29 
 
 
738 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0744  fatty oxidation complex, alpha subunit  26.29 
 
 
738 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  42.86 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1391  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  43.02 
 
 
706 aa  67  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.587506 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0248  enoyl-CoA hydratase  32.62 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1312  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.37 
 
 
714 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474156  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.81 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  31.54 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3378  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.31 
 
 
721 aa  66.6  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4162  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.1 
 
 
723 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001988  fatty oxidation complex alpha subunit FadB  27.17 
 
 
723 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.1 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5646  enoyl-CoA hydratase  29.56 
 
 
272 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.906008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0021  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  26.04 
 
 
740 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0807  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.02 
 
 
671 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.990603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0234  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.65 
 
 
691 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  29.76 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1087  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  36.78 
 
 
696 aa  66.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4959  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.28 
 
 
703 aa  66.6  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.520372  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0835  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  26.26 
 
 
737 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  30.2 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.03 
 
 
659 aa  66.2  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  25.94 
 
 
717 aa  66.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  30.56 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2046  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  26.95 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.577666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>