More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00068 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00068  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
289 aa  592  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.279285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1830  enoyl-CoA hydratase  79.72 
 
 
289 aa  474  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0401  enoyl-CoA hydratase  65.71 
 
 
290 aa  391  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0460  enoyl-CoA hydratase  65.36 
 
 
290 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2657  enoyl-CoA hydratase  39.63 
 
 
296 aa  202  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000176785  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0083  enoyl-CoA hydratase  41.03 
 
 
291 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.293903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2672  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
300 aa  196  3e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3965  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
287 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224001  normal  0.0275416 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3555  enoyl-CoA hydratase  37.23 
 
 
287 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5972  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
337 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.629143  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3463  enoyl-CoA hydratase  36.52 
 
 
287 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5121  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
287 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2572  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
287 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5286  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5455  enoyl-CoA hydratase  37.81 
 
 
294 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1151  enoyl-CoA hydratase  37.81 
 
 
295 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5278  enoyl-CoA hydratase  37.1 
 
 
292 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2182  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
289 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4743  enoyl-CoA hydratase  33.1 
 
 
292 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0246  enoyl-CoA hydratase  40.37 
 
 
316 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.107145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  36.31 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001548  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  31.05 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2473  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0123769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5442  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  33.96 
 
 
692 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.95 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1547  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  37.12 
 
 
637 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000330184  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0871  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.76 
 
 
733 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274544  normal  0.255426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2196  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  33.12 
 
 
733 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2296  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.32 
 
 
733 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0498379  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  35.94 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  37.61 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 
272 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1480  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.68 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857901  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1733  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.69 
 
 
744 aa  72  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.535937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1841  short chain enoyl-CoA hydratase  34.38 
 
 
150 aa  72  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2881  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.17 
 
 
715 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452872  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1400  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.1 
 
 
747 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1670  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141752 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  24.2 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0817  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  27.4 
 
 
737 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.85082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.18 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1509  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.1 
 
 
774 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.807341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0382  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.1 
 
 
775 aa  71.2  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  31.02 
 
 
303 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000372  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.53 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.616977  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4260  enoyl-CoA hydratase  33.14 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1391  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  40 
 
 
706 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.587506 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05485  enoyl-CoA hydratase  30.51 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1312  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.89 
 
 
714 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.474156  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2780  enoyl-CoA hydratase  31.52 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  27.03 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  27.03 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  25.77 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  27.03 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  27.03 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  30.48 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4162  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  43.33 
 
 
723 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0276  enoyl-CoA hydratase  35.9 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.274278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1376  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.06 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.821912  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1515  enoyl-CoA hydratase  33.79 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0234  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.19 
 
 
691 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0543  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.17 
 
 
736 aa  69.7  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247405  normal  0.0940574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1378  enoyl-CoA hydratase  31.79 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0250374 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  32.24 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  34.32 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.67 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.22 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0744  fatty oxidation complex, alpha subunit  27.49 
 
 
738 aa  69.3  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0793  fatty oxidation complex, alpha subunit  27.49 
 
 
738 aa  69.3  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  29.13 
 
 
663 aa  68.9  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0690  putative fatty oxidation complex, alpha subunit  32.58 
 
 
675 aa  68.9  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4959  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.86 
 
 
703 aa  69.3  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.520372  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.02 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0835  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  29.48 
 
 
737 aa  69.3  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2500  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.44 
 
 
714 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273227  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08370  short chain enoyl-CoA hydratase  32.39 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0645146  normal  0.165598 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02265  fused enoyl-CoA hydratase and epimerase and isomerase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  26.55 
 
 
714 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1316  fatty acid oxidation complex, alpha subunit FadJ  28.89 
 
 
714 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2377  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.21 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2492  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.55 
 
 
714 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3484  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.55 
 
 
714 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.591904  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02226  hypothetical protein  26.55 
 
 
714 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.41 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.76 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2721  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  31.47 
 
 
714 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.33 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1645  short chain enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0517  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.61 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0525894  normal  0.0523388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2637  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  31.47 
 
 
714 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3199  enoyl-CoA hydratase  29.41 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00556832 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0887  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.68 
 
 
738 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.703103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3553  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  38.1 
 
 
699 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.933937  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  33.14 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0372  short chain enoyl-CoA hydratase  34.69 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1664  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.67 
 
 
717 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0455542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4031  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  27.49 
 
 
738 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>