More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2672 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2672  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
300 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0083  enoyl-CoA hydratase  53.85 
 
 
291 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.293903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2657  enoyl-CoA hydratase  44.91 
 
 
296 aa  247  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000176785  normal  0.751321 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5972  enoyl-CoA hydratase  45.96 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.629143  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0401  enoyl-CoA hydratase  39.93 
 
 
290 aa  198  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5455  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
294 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00068  enoyl-CoA hydratase  40.77 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.279285  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0460  enoyl-CoA hydratase  39.93 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1830  enoyl-CoA hydratase  40 
 
 
289 aa  194  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1151  enoyl-CoA hydratase  39.42 
 
 
295 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3463  enoyl-CoA hydratase  40.07 
 
 
287 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2182  enoyl-CoA hydratase  39.41 
 
 
289 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5286  enoyl-CoA hydratase  39.34 
 
 
287 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2572  enoyl-CoA hydratase  39.71 
 
 
287 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5278  enoyl-CoA hydratase  38.91 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0498797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3965  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
287 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224001  normal  0.0275416 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3555  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
287 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169518  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0246  enoyl-CoA hydratase  42.06 
 
 
316 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.107145 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5121  enoyl-CoA hydratase  38.97 
 
 
287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4743  enoyl-CoA hydratase  37.77 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08370  short chain enoyl-CoA hydratase  34.12 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0645146  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2897  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.03 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2936  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.44 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4190  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.23 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.164544  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2522  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1171  enoyl-CoA hydratase  29.55 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.83 
 
 
651 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.52 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0729308  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  30.94 
 
 
659 aa  79  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0718  enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471174  normal  0.211239 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11811  enoyl-coa hydratase  38.06 
 
 
203 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3660  enoyl-CoA hydratase  29.3 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1234  enoyl-CoA hydratase  29.15 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.134815  normal  0.668233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1374  enoyl-CoA hydratase  31.29 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0833135  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0400  short chain enoyl-CoA hydratase  37.06 
 
 
270 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0904838  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54640  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194737  hitchhiker  0.0000224926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13550  enoyl-CoA hydratase  29.78 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4775  enoyl-CoA hydratase  30.34 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3879  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  30.59 
 
 
715 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.18 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.16 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509119  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2607  enoyl-CoA hydratase  30.86 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.43779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1395  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  33.13 
 
 
715 aa  73.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3237  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1547  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  29.78 
 
 
637 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000330184  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1663  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.67 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.283423 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1580  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.82 
 
 
715 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120976  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6065  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.638371  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2993  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.91 
 
 
696 aa  73.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251416  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2046  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.95 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366637  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.07 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3537  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50917e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3322  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3285  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000573094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3583  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1087  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.17 
 
 
696 aa  72.8  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11088  enoyl-CoA hydratase  29.29 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0399052  normal  0.611468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1377  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  28.57 
 
 
260 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2145  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.3 
 
 
715 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.11 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09590  short chain enoyl-CoA hydratase  30.65 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0374629  normal  0.0718522 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  28.07 
 
 
259 aa  72.4  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  24.6 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25080  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.3 
 
 
715 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2131  enoyl-CoA hydratase  28.99 
 
 
259 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.540792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  29.41 
 
 
716 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0734076  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02840  short chain enoyl-CoA hydratase  41.94 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.480651  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2708  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0023  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  34.04 
 
 
716 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2687  enoyl-CoA hydratase  31.03 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.485301  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0902  enoyl-CoA hydratase  26.61 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  30.29 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1007  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.98 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.06 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.06 
 
 
269 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.28 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  36.89 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0224  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.98 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  26.55 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.06 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4093  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.29 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  28.8 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4900  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171259  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  26.92 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.46 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4381  enoyl-CoA hydratase  30.23 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.124836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  30.99 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.37 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4162  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  30.59 
 
 
723 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1806  enoyl-CoA hydratase  29.71 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.595083  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4354  enoyl-CoA hydratase  36.69 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8123  enoyl-CoA hydratase  32.16 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.402683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28460  short chain enoyl-CoA hydratase  35.37 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528871  normal  0.841191 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  25 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>