167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0245 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0245  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1090    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1461  hypothetical protein  38.32 
 
 		 592 aa  231  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.523283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 		 621 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 586 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 624 aa  137  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 570 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  31.06 
 
 		 580 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 565 aa  104  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.25 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 		 725 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 537 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  38 
 
 		 402 aa  98.2  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.59 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.15 
 
 		 417 aa  92.8  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 587 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  38.21 
 
 		 442 aa  92  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 594 aa  91.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 		 435 aa  90.1  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.06 
 
 		 403 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  34.93 
 
 		 463 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  39.71 
 
 		 412 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  33.05 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.04 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 576 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  34.7 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  34.27 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 595 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  38.35 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  37.96 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  31.65 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  34.98 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 618 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  33.61 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 445 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  38.17 
 
 		 326 aa  73.2  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  36.04 
 
 		 439 aa  72  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  36.52 
 
 		 433 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.38 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4244  hypothetical protein  30.41 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  33.5 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  33.92 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.58 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  31.58 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.38 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  37.58 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  39.85 
 
 		 374 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 388 aa  67  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  30.85 
 
 		 489 aa  66.6  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  29.19 
 
 		 429 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  38.41 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  29.5 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 492 aa  65.1  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  45.54 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  41.36 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.29 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  30.62 
 
 		 389 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  32.99 
 
 		 237 aa  63.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 465 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  29.67 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  29.61 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  34.82 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1744  putative signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 723 aa  60.8  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0103404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.6 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  37.04 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  29.13 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  30.56 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  29.52 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  29.61 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  27.78 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  32.21 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>