49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4244 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4244  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  859    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.7 
 
 		 595 aa  323  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2503  hypothetical protein  40 
 
 		 639 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 594 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 621 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 586 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 624 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 537 aa  77  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0245  hypothetical protein  39.55 
 
 		 578 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  41.86 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  36.13 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1461  hypothetical protein  38.51 
 
 		 592 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.523283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 		 435 aa  57  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 466 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  40 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  37.07 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  36.89 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  42.68 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  39.53 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  38.36 
 
 		 416 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 447 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  44.29 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  33.04 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  40.24 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  35.71 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 618 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  39.36 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  37.8 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.89 
 
 		 508 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.14 
 
 		 405 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 405 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  35.24 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  40.24 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 775 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  36.59 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  35.19 
 
 		 580 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 445 aa  43.9  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.35 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  38.55 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  32.22 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  36.78 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>