21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2503 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2503  hypothetical protein  100 
 
 		 639 aa  1199    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.116558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4244  hypothetical protein  40.65 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 595 aa  197  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 587 aa  187  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 594 aa  173  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 586 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 621 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0245  hypothetical protein  32.34 
 
 		 578 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 570 aa  50.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  33.76 
 
 		 433 aa  50.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1734  histidine kinase  23.21 
 
 		 397 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 624 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  29.8 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 444 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 		 381 aa  48.1  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5452  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 556 aa  47.8  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  26.06 
 
 		 381 aa  47.8  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  33.12 
 
 		 429 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  31.03 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 438 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  36.59 
 
 		 452 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>