More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2388 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
618 aa  1145    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  46.83 
 
 
570 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  43.95 
 
 
537 aa  349  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.29 
 
 
565 aa  333  4e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
586 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  33.28 
 
 
580 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
621 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
624 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
461 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
594 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.36 
 
 
395 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  39.39 
 
 
442 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
587 aa  130  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.08 
 
 
403 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
417 aa  124  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  38.49 
 
 
452 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
405 aa  117  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  36.54 
 
 
402 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
388 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  38.85 
 
 
416 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  37.55 
 
 
463 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  36.11 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
444 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
326 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  42.74 
 
 
429 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  33.46 
 
 
388 aa  107  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.2 
 
 
405 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 
435 aa  107  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
492 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
435 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
445 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
435 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
435 aa  105  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
445 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.08 
 
 
415 aa  105  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  34.11 
 
 
429 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  38.89 
 
 
463 aa  104  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
375 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  35.9 
 
 
383 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  38.33 
 
 
439 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
382 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.08 
 
 
386 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  35.77 
 
 
410 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  33.07 
 
 
433 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1461  hypothetical protein  41.79 
 
 
592 aa  100  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.523283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  32.05 
 
 
430 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.36 
 
 
408 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  34.88 
 
 
489 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  34.77 
 
 
420 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  37.1 
 
 
374 aa  99.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
343 aa  99.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3029  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 
815 aa  99  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00871852  hitchhiker  0.00628617 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  33.33 
 
 
476 aa  98.2  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0245  hypothetical protein  31.56 
 
 
578 aa  97.8  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
725 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
408 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
438 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1434  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
731 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.278277  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
640 aa  94.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  35.98 
 
 
438 aa  94  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
466 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
418 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
417 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
433 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  40 
 
 
412 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.47 
 
 
433 aa  90.9  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  35.77 
 
 
410 aa  90.5  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.85 
 
 
508 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
454 aa  89.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  36.19 
 
 
434 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  40 
 
 
434 aa  88.2  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
459 aa  88.2  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
432 aa  87.8  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
444 aa  87  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  33.33 
 
 
237 aa  85.9  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  43.86 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
401 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
470 aa  83.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  30.37 
 
 
489 aa  83.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  29.97 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.25 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  34.78 
 
 
419 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  31.88 
 
 
687 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
595 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  25.46 
 
 
670 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  34.8 
 
 
451 aa  79  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  35.4 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4344  ATPase domain-containing protein  29.5 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>