94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2714 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2714  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.375207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2842  hypothetical protein  46.13 
 
 		 314 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.287956  normal  0.307583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5068  hypothetical protein  45.63 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3059  hypothetical protein  45.63 
 
 		 315 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3208  hypothetical protein  45.95 
 
 		 315 aa  265  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4377  hypothetical protein  44.84 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5802  hypothetical protein  44.34 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0267653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5058  hypothetical protein  44.34 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799833  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26380  Twin-arginine translocation pathway signal  40.85 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.933141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1165  hypothetical protein  23.57 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.76 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.511755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1667 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  21.82 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.21 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3113  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.09 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.26 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.15 
 
 		 366 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.21 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.63 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  24.86 
 
 		 819 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  21.24 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  30.1 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.98 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1535  putative surface antigen protein  22.89 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  21.29 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5063  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 961 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2611  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.31 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6860  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.64 
 
 		 358 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  23.85 
 
 		 810 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.34 
 
 		 406 aa  49.7  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  24.81 
 
 		 1094 aa  49.7  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5265  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.85 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2827  putative surface layer protein  22.77 
 
 		 351 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000573222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  26.36 
 
 		 457 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1990  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.09 
 
 		 470 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.86 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1117  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.3 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.12 
 
 		 752 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.26 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.48 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  24.46 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.95 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  35.44 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.91 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.44 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6812  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.02 
 
 		 363 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.444472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1750  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.86 
 
 		 451 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000566962  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1170 aa  46.6  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  24.29 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0031  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.870241  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1622  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30 
 
 		 974 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.45 
 
 		 348 aa  45.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.18 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.73 
 
 		 192 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  25 
 
 		 575 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.91 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.68 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.54 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0029  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.77 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5392  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.77 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0101451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.47 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.14 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0028  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.77 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  decreased coverage  0.000046618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.77 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.802386 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.57 
 
 		 335 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  20.45 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  21.93 
 
 		 580 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.85 
 
 		 353 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.08 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.07 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2833  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.64 
 
 		 931 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5386  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.72 
 
 		 479 aa  43.9  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3230  hypothetical protein  24.64 
 
 		 931 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.64 
 
 		 348 aa  43.5  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  26.25 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  28.15 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3013  hypothetical protein  28.03 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  21.72 
 
 		 487 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.31 
 
 		 689 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  25.3 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.74 
 
 		 334 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2304  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  20.8 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0594691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.32 
 
 		 324 aa  42.7  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5399  hypothetical protein  27.2 
 
 		 500 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  25.19 
 
 		 250 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  21.97 
 
 		 391 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2207  hypothetical protein  20.5 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0353672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  25.18 
 
 		 971 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07650  YVTN family beta-propeller repeat protein  34.85 
 
 		 461 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.446575  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.03 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1949 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6317  putative lipoprotein  23.97 
 
 		 963 aa  42.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1470  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.95 
 
 		 479 aa  42.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00488394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>