104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3754 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  55.73 
 
 		 194 aa  224  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  55.9 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  55.9 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  55.9 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  55.9 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  55.9 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  55.9 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  55.9 
 
 		 195 aa  207  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  53.33 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  54.87 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  53.33 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  53.33 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  53.33 
 
 		 195 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  53.33 
 
 		 195 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  53.33 
 
 		 195 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  52.82 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  52.31 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  53.76 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  53.72 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  53.72 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  53.72 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  53.72 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  53.72 
 
 		 194 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  53.72 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  53.72 
 
 		 188 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  54.26 
 
 		 194 aa  198  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  53.65 
 
 		 194 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  53.65 
 
 		 194 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  52.31 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  55 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  53.12 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  53.12 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  53.12 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  51.28 
 
 		 195 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  53.93 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  56.07 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  57.4 
 
 		 195 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  55.84 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  52.75 
 
 		 194 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  53.16 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  54.55 
 
 		 195 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  53.65 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  53.81 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  51.69 
 
 		 205 aa  184  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  54.29 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  51.69 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  49.43 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  50.86 
 
 		 194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  49.43 
 
 		 196 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  51.61 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  42.5 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  44.67 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  42.22 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  43.87 
 
 		 191 aa  122  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  44.08 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  44.08 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  42.86 
 
 		 190 aa  114  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  40.13 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  44.08 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  46.28 
 
 		 167 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  33.76 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  29.94 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  34.72 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  33.79 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  37.5 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  36.92 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  32.06 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  29.88 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  34.59 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  33.85 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  33.59 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  32.58 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  32.58 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  33.33 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  32.33 
 
 		 222 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  31.3 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  31.18 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  31.54 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  30.49 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  32.26 
 
 		 260 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  35.11 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  30.6 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  34.35 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  34.56 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2464  hypothetical protein  30.67 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  30.97 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  25.95 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  32.35 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  26.9 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0886  protein of unknown function DUF500  29.41 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  29.65 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>