114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1822 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  98.97 
 
 		 195 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  96.41 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  96.41 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  96.41 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  96.41 
 
 		 195 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  90.26 
 
 		 195 aa  354  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  89.23 
 
 		 195 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  89.23 
 
 		 195 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  89.23 
 
 		 195 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  89.23 
 
 		 195 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  89.23 
 
 		 195 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  89.23 
 
 		 195 aa  352  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  89.23 
 
 		 195 aa  352  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  93.85 
 
 		 195 aa  352  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  84.62 
 
 		 194 aa  330  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  84.1 
 
 		 194 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  84.1 
 
 		 194 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  82.05 
 
 		 194 aa  320  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  82.05 
 
 		 194 aa  320  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  82.05 
 
 		 194 aa  320  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  86.26 
 
 		 194 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  79.79 
 
 		 194 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  79.79 
 
 		 194 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  79.79 
 
 		 194 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  79.79 
 
 		 194 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  79.79 
 
 		 194 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  79.79 
 
 		 194 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  80.85 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  80.85 
 
 		 188 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  71.28 
 
 		 195 aa  288  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  70.26 
 
 		 195 aa  287  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  70.77 
 
 		 195 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  63.59 
 
 		 195 aa  262  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  62.56 
 
 		 195 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  61.22 
 
 		 196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  57.22 
 
 		 195 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  60.2 
 
 		 196 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  55.96 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  56.63 
 
 		 198 aa  221  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  58.46 
 
 		 195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  52.85 
 
 		 196 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  52.58 
 
 		 192 aa  206  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  56.57 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  54.08 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  56 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  50.51 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  50 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  55.81 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  48.99 
 
 		 194 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  52.66 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  45 
 
 		 188 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  45.33 
 
 		 190 aa  124  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  40.24 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  38.8 
 
 		 189 aa  117  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  34.92 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  38.34 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  50.82 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  43.14 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  38.67 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  38.67 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  38.67 
 
 		 185 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  34.02 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  38.19 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  36.27 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  30.37 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  33.91 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  30.64 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  29.1 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  32.18 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  30 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  31.88 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  31.11 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  27.64 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  32.06 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  29.46 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  25.27 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  32.93 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  27.7 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  27.95 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  30.77 
 
 		 299 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  31.25 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  27.61 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  35.37 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  27.27 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  31.78 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  31.78 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  31.68 
 
 		 297 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  29.17 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  31.06 
 
 		 229 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  26.47 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  27.81 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  27.43 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  26.39 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  28.74 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  30.15 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>