26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2706 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  100 
 
 		 192 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  72.38 
 
 		 189 aa  277  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  58.73 
 
 		 195 aa  238  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  57.29 
 
 		 195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  61.36 
 
 		 194 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  58.96 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  30.6 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  31.22 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  28.95 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  25 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  30.82 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  28.3 
 
 		 259 aa  52  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  31.08 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  28.86 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  28.86 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  28.86 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  28.72 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  30 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  25.14 
 
 		 182 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  30 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  29.73 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>