15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2686 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  85.13 
 
 		 195 aa  353  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  75.26 
 
 		 194 aa  300  8.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  79.07 
 
 		 189 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  58.73 
 
 		 192 aa  238  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  57.22 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  29.71 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  28.33 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  30 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  30.91 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  29.7 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  29.19 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  25.44 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>