61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000649 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  81.47 
 
 
259 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  36.42 
 
 
193 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  33.94 
 
 
190 aa  95.1  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  36.65 
 
 
190 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  34.27 
 
 
197 aa  88.2  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  30.82 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  33.96 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  30.91 
 
 
195 aa  63.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  30.43 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  31.51 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  28.95 
 
 
178 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1531  putative lipoprotein  27.54 
 
 
214 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.009595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  31.45 
 
 
195 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  28.21 
 
 
197 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1395  putative lipoprotein  27.33 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.483754  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  28.3 
 
 
189 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  25.66 
 
 
178 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  26.67 
 
 
181 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  26.62 
 
 
188 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  24.43 
 
 
203 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  26.32 
 
 
177 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  32.08 
 
 
189 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.48 
 
 
194 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  26.75 
 
 
186 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  27.87 
 
 
188 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  27.81 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  28.4 
 
 
194 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  24.53 
 
 
182 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  25.97 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  27.81 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  28.22 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  28.22 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  28.22 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  27.33 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  27.81 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  28.22 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  28.22 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  28.22 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  27.33 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  27.81 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  28.22 
 
 
195 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  26.99 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  26.99 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  26.99 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  26.99 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  26.99 
 
 
194 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  25.37 
 
 
185 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  29.3 
 
 
194 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  26.92 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  27.61 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  30.97 
 
 
194 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  26.99 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  26.54 
 
 
194 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  26.99 
 
 
195 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  24.53 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  23.57 
 
 
188 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  25.47 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  27.16 
 
 
195 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  23.12 
 
 
193 aa  42.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>