111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3541 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  354  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4205  hypothetical protein  55.91 
 
 		 188 aa  194  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  55.74 
 
 		 190 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  53.51 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  57.65 
 
 		 186 aa  184  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0256  hypothetical protein  55.8 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.140165  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0283  hypothetical protein  58.29 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  52.38 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  51.85 
 
 		 193 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4069  hypothetical protein  51.05 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4044  hypothetical protein  51.05 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4162  hypothetical protein  51.05 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  51.32 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  51.32 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3665  hypothetical protein  57.58 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.821634  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3967  hypothetical protein  52.11 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  60.24 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  49.19 
 
 		 188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0402  hypothetical protein  53.7 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3329  hypothetical protein  56.17 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  48.1 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  50 
 
 		 185 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  49.09 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  48.45 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  41.36 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  37.04 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  38.79 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  36.04 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  37.89 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  39.74 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  38.93 
 
 		 234 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  32.53 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  29.36 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  34.75 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  26.85 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  28.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  32.86 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  30.46 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  30 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  25.68 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  34.82 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  25.68 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  25.68 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  26.09 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2347  hypothetical protein  36.27 
 
 		 274 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  25.79 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  28.37 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  29.05 
 
 		 259 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  37.84 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  26.39 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  32.63 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  28.47 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  26.39 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  28.47 
 
 		 231 aa  48.5  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  25.28 
 
 		 267 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  25.33 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  25.68 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  25.68 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  30.07 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  25.68 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  23.89 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  29.45 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  31.43 
 
 		 297 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1181  hypothetical protein  28.39 
 
 		 238 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.09 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  28.79 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  27.66 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  25 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  25 
 
 		 188 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  24.84 
 
 		 259 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  27.86 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  25 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  27.14 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  28.43 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  27.14 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  33 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  32.35 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202926 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>