20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2685 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  100 
 
 		 195 aa  403  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  85.13 
 
 		 195 aa  353  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  75.13 
 
 		 194 aa  294  7e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  79.19 
 
 		 189 aa  271  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  57.29 
 
 		 192 aa  232  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  55.68 
 
 		 189 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  29.67 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  29.48 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  29.49 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  31.45 
 
 		 259 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  25.39 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  29.32 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  28.93 
 
 		 259 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  31.74 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 194 aa  42  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>