46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0436 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  72.38 
 
 		 192 aa  277  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  57.22 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  55.68 
 
 		 195 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  56.68 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  56.4 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  32.58 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  29.14 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  26.35 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  30.29 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  29.89 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  29.89 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  30.41 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  30.41 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  30.41 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  30.46 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  28.99 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  29.14 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  27.43 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  29.14 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  27.27 
 
 		 259 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  28.74 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  26.06 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  29.05 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  29.05 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  29.05 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  28.16 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  31.54 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  39.06 
 
 		 188 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>