69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06518 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06518  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000649  hypothetical protein  81.47 
 
 		 259 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  35.76 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4149  putative lipoprotein  35.98 
 
 		 190 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  33.95 
 
 		 193 aa  92.8  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1996  putative lipoprotein  34.27 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1218  putative lipoprotein  30.82 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2686  putative lipoprotein  29.7 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.298289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2706  putative lipoprotein  28.3 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  28.26 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1057  putative lipoprotein  29.94 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2685  putative lipoprotein  28.93 
 
 		 195 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.29359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1531  putative lipoprotein  27.06 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.009595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15731  hypothetical protein  24.63 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.448321 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  26.75 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1279  hypothetical protein  25.32 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0436  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 189 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  28.92 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  28.92 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  53.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  26.11 
 
 		 186 aa  52.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1341  putative lipoprotein  27.04 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00268947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  29.01 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  23.53 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  23.19 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  30.46 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3541  hypothetical protein  23.03 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.193134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  29.33 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 188 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 188 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  29.45 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  28.67 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  28.67 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  28.67 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  27.61 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1395  putative lipoprotein  24.54 
 
 		 228 aa  48.9  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.483754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2288  hypothetical protein  24.36 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  28.67 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  24.68 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0162  hypothetical protein  27.85 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  29.01 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12081  hypothetical protein  23.27 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.525189  normal  0.755265 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  28.35 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  28.21 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1170  hypothetical protein  24.11 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.215934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0322  hypothetical protein  22.73 
 
 		 193 aa  46.2  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  28.22 
 
 		 195 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  27.61 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  27.61 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  25.83 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  24.05 
 
 		 188 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0293  hypothetical protein  22.08 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3847  hypothetical protein  22.08 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3651  hypothetical protein  22.08 
 
 		 193 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.676739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  21.82 
 
 		 190 aa  42.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  26.38 
 
 		 195 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  26.38 
 
 		 195 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  26.38 
 
 		 195 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>