More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1185 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1185  putative type VI secretion protein VasX-1  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.451902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5881  serine/threonine protein kinase  36.25 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00553777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 		 483 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  38.54 
 
 		 907 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  37.36 
 
 		 1188 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4032  protein kinase  33.33 
 
 		 358 aa  58.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.144415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1863  serine/threonine protein kinase  30.85 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03755  normal  0.81894 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.22 
 
 		 648 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6929  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 		 352 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 573 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35807  predicted protein  29.01 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05865  serine-threonine protein kinase  35.87 
 
 		 686 aa  55.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38920  predicted protein  26.81 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.540489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 1122 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  37.21 
 
 		 825 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  34.41 
 
 		 426 aa  54.7  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3601  serine-threonine kinase Stk1  32.99 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42880  serine-threonine kinase Stk1  32.99 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.576441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 		 866 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3668  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 367 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3396  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 		 604 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0692149  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  35.44 
 
 		 790 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 503 aa  53.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 581 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  37.04 
 
 		 666 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  27.64 
 
 		 617 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000443  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 666 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2697  serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 691 aa  53.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3674  serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 340 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1859  predicted protein  30.43 
 
 		 293 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.297964  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29193  predicted protein  33.03 
 
 		 396 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00865439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0833  protein kinase  38.37 
 
 		 650 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1320 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.54 
 
 		 971 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 		 493 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  30.39 
 
 		 559 aa  53.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 632 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 		 565 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  23.68 
 
 		 554 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 		 610 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.47 
 
 		 601 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  35.92 
 
 		 871 aa  52.8  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  28.57 
 
 		 501 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42248  predicted protein  31.11 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  29.91 
 
 		 569 aa  52.4  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  25.84 
 
 		 425 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6039  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 301 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0065  kinase domain protein  33.72 
 
 		 613 aa  52.4  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0464349 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04279  cell-cycle checkpoint serine-threonine kinase (Eurofung)  38.75 
 
 		 630 aa  52  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.631432 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 		 601 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_4341  predicted protein  29.41 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1432  cyclic nucleotide-binding protein  31.75 
 
 		 431 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  30.7 
 
 		 781 aa  52  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 		 691 aa  51.6  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  27.5 
 
 		 869 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  31.91 
 
 		 519 aa  51.6  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5322  serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 671 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 1402 aa  51.2  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  39.71 
 
 		 763 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.12 
 
 		 1666 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  29.41 
 
 		 736 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 695 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  35.53 
 
 		 556 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  31.03 
 
 		 661 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  33 
 
 		 650 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  29.52 
 
 		 614 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1389  serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 752 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214576  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 444 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  33.66 
 
 		 1018 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3182  protein kinase  32.08 
 
 		 494 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0356849  normal  0.234738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.43 
 
 		 916 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 		 562 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 647 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0193  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 		 314 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  29.14 
 
 		 1922 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4035  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4955  protein kinase  30.48 
 
 		 279 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2671  serine/threonine protein kinase  46.81 
 
 		 552 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1309  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 517 aa  50.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48170  predicted protein  35.53 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.996988  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5817  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 384 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.49 
 
 		 668 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  26.09 
 
 		 2303 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 		 505 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5416  serine/threonine protein kinase, putative  31.58 
 
 		 331 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.49 
 
 		 693 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.53 
 
 		 668 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.68 
 
 		 525 aa  49.7  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.5 
 
 		 716 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 653 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  29.91 
 
 		 820 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0027  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 		 529 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.63 
 
 		 653 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  31.68 
 
 		 1032 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  28.57 
 
 		 758 aa  49.7  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.9 
 
 		 1845 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  31.11 
 
 		 412 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>