More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4032 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4032  protein kinase  100 
 
 
358 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.144415  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3674  serine/threonine protein kinase  56.96 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52317  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  33.19 
 
 
360 aa  89  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.41 
 
 
971 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.84 
 
 
880 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  31.18 
 
 
1774 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.71 
 
 
681 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3721  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  34.92 
 
 
668 aa  80.5  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 
536 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.96 
 
 
863 aa  79.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
776 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
774 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.84 
 
 
647 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 
652 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  30.43 
 
 
653 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 
615 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1579  serine/threonine protein kinase  35.08 
 
 
297 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.51 
 
 
613 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24040  protein kinase family protein  30.94 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0282375 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
673 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 
581 aa  76.6  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0009  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.06 
 
 
620 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
1415 aa  76.3  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.71 
 
 
664 aa  76.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  34.13 
 
 
635 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  29.9 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  35.46 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.33 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2934  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
660 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  37.3 
 
 
691 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  29.45 
 
 
687 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.63 
 
 
698 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5401  protein kinase  34.84 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.223207 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  32.95 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.71 
 
 
636 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0353  serine/threonine kinase protein  30.68 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.638448  normal  0.179862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.19 
 
 
916 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 
651 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.92 
 
 
676 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.4 
 
 
642 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
557 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  29.85 
 
 
889 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
651 aa  73.2  0.000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 
465 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.3 
 
 
700 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0111  serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 
526 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.380254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.06 
 
 
627 aa  72.8  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  36.05 
 
 
414 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 
587 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  28.12 
 
 
907 aa  72.4  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2041  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.86 
 
 
884 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.443497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  31.75 
 
 
625 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.14 
 
 
601 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  36.73 
 
 
414 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.71 
 
 
603 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
871 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2684  Serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 
553 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126433  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  29.03 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1590  serine/threonine protein kinase  33.89 
 
 
769 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135919  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
863 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
892 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  29.13 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  28.5 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4022  transcriptional regulator, XRE family  30.56 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  30.95 
 
 
625 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 
641 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.5 
 
 
620 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 
985 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  38.02 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
1479 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0122  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0828115 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  34.5 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  27.04 
 
 
623 aa  70.1  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 
646 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
1289 aa  70.1  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  30.18 
 
 
626 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0456  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 
490 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.959747  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.12 
 
 
757 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 
770 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0125  serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
457 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4320  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
590 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0909086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  38.02 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  27.06 
 
 
426 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 
691 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0475  Serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0064  serine/threonine protein kinase  33.61 
 
 
538 aa  69.7  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
582 aa  69.7  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
531 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 
855 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0808  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.369013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>