More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3674 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3674  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
340 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52317  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4032  protein kinase  56.85 
 
 
358 aa  323  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.144415  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.75 
 
 
880 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  34.2 
 
 
889 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  33.2 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 
503 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2867  serine/threonine protein kinase  39.71 
 
 
615 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446  normal  0.384542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.95 
 
 
863 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 
1415 aa  79.7  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2915  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
533 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0709852  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  33.04 
 
 
559 aa  77.8  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0125  serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4049  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.2 
 
 
971 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 
486 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
450 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  31 
 
 
554 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0122  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 
457 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0828115 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0202  Serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2528  Serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.9 
 
 
676 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
557 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  34.19 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  27.21 
 
 
687 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.29 
 
 
603 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6388  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3721  serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  28.35 
 
 
569 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0925  cyclic nucleotide-binding:protein kinase  28.79 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  31.6 
 
 
581 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0080  serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 
928 aa  73.9  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  33.87 
 
 
673 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
776 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.29 
 
 
664 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  30.71 
 
 
907 aa  73.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.54 
 
 
627 aa  73.2  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.84 
 
 
620 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6471  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.68 
 
 
613 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.81 
 
 
636 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  33.06 
 
 
635 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.14 
 
 
664 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1421  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
871 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.27367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  32.85 
 
 
1774 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0472  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
554 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 
528 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3275  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
855 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667019  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 
587 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.1 
 
 
700 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  29.72 
 
 
652 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.98 
 
 
1479 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  29.21 
 
 
625 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.07 
 
 
681 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  32.07 
 
 
577 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  32.83 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.21 
 
 
916 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1698  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 
461 aa  70.1  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00790624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.47 
 
 
869 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  33.17 
 
 
700 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.95 
 
 
520 aa  70.1  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
575 aa  69.7  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.75 
 
 
518 aa  69.7  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.81 
 
 
698 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.95 
 
 
645 aa  69.7  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35230  serine/threonine protein kinase  35.61 
 
 
531 aa  69.3  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.812554  normal  0.572815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0858  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.31 
 
 
479 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  32.45 
 
 
1358 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 
691 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
619 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  39.05 
 
 
555 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
750 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4023  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 
572 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
536 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5095  serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 
585 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0160466  normal  0.222813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.9 
 
 
630 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  36.72 
 
 
585 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4523  serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 
439 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0864  serine/threonine protein kinase  38.66 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.572478  normal  0.162904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  28.71 
 
 
625 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3378  protein kinase  29.2 
 
 
544 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.48624  decreased coverage  0.000240313 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  28.21 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2084  Serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000649074  unclonable  0.000000262207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1225  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  30.69 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.553503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.75 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1111  serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
527 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0331309  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0112  protein kinase  30.85 
 
 
469 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351579  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  37.69 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.35 
 
 
584 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 
628 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4028  serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 
493 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0137121  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0621  serine/threonine kinase protein  28.57 
 
 
407 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109473  hitchhiker  0.00845056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  31.5 
 
 
668 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2673  serine/threonine protein kinase  32.74 
 
 
540 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0573698  normal  0.794147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4798  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.08 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263981  normal  0.132611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>