More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0065 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0065  kinase domain protein  100 
 
 		 613 aa  1264    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0464349 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1455  serine/threonine protein kinase  69.93 
 
 		 739 aa  412  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2948  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 		 638 aa  243  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31690  protein kinase family protein  50.19 
 
 		 643 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0677  serine/threonine protein kinase  46.64 
 
 		 898 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000321455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2062  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 		 617 aa  233  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0797  serine/threonine protein kinase  45.34 
 
 		 587 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.367858  normal  0.015256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03850  protein kinase family protein  44.62 
 
 		 651 aa  193  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0921  protein kinase  32.47 
 
 		 651 aa  177  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0130475  normal  0.23221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3365  protein kinase  38.82 
 
 		 545 aa  177  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2563  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000933415  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1299  serine/threonine protein kinase  41.03 
 
 		 608 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3577  serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 		 624 aa  174  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0586603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3910  serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 		 637 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 		 416 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2229  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  34.42 
 
 		 644 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277557  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0592  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  25.46 
 
 		 603 aa  160  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7386  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.99 
 
 		 585 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2849  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 		 709 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0842  serine/threonine protein kinase  37.87 
 
 		 695 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000042013  decreased coverage  0.00000000202513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8115  Serine/threonine protein kinase-like protein  40.68 
 
 		 438 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311057  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3758  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 		 455 aa  157  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0619  serine/threonine protein kinase  36.3 
 
 		 589 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1696  serine/threonine protein kinase  38.03 
 
 		 569 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2507  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.34 
 
 		 421 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4260  serine/threonine protein kinase  38.31 
 
 		 551 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0338869  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.77 
 
 		 599 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4915  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 586 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.636265  hitchhiker  0.00645126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  35.59 
 
 		 573 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2848  serine/threonine protein kinase  35.69 
 
 		 617 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.93 
 
 		 806 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 		 721 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7263  Serine/threonine protein kinase-like protein  41 
 
 		 594 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0000272389  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1130  serine/threonine protein kinase  36.02 
 
 		 555 aa  150  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07540  serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 		 689 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.349835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0089  serine/threonine protein kinase  33.76 
 
 		 571 aa  150  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0255  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 754 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0438219  normal  0.0628344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1754  serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.02 
 
 		 751 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1406  Serine/threonine protein kinase-like protein  32.91 
 
 		 716 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.84 
 
 		 600 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8117  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.47 
 
 		 733 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8116  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.46 
 
 		 654 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2455  serine/threonine protein kinase  41.06 
 
 		 533 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.40306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 		 820 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.39 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4730  serine/threonine protein kinase  36.93 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2448  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.54 
 
 		 641 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0505628 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4012  serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 		 528 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2614  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.72 
 
 		 1148 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5221  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 716 aa  145  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0344538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0531  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 		 612 aa  144  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.145867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8906  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 		 525 aa  144  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.34 
 
 		 898 aa  144  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  37.02 
 
 		 557 aa  144  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5943  serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 		 680 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.545721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1927  serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 		 522 aa  143  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.24 
 
 		 1190 aa  143  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3437  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 		 771 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  36.24 
 
 		 742 aa  142  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0163  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 		 569 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.910763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.78 
 
 		 1256 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  38.12 
 
 		 766 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7072  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 644 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3954  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.09 
 
 		 587 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  38.57 
 
 		 734 aa  140  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1079  serine/threonine protein kinase  35.62 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1517  serine/threonine protein kinase  36.07 
 
 		 547 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00657769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5809  serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 		 487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6929  serine/threonine protein kinase  36.86 
 
 		 352 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0023  serine/threonine protein kinase  36.32 
 
 		 560 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1446  serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 		 646 aa  137  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0259009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1756  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  31.68 
 
 		 608 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2884  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 		 525 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.824247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2361  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  37.95 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25260  protein kinase family protein  38.76 
 
 		 501 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.981301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0631  serine/threonine protein kinase  36.49 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  35.27 
 
 		 638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6100  serine/threonine protein kinase  35.09 
 
 		 624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3911  serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 632 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3605  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 		 481 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1619  serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 		 703 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.682192  normal  0.0463489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2474  serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 738 aa  133  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5207  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.39 
 
 		 618 aa  133  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517469  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1460  serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 		 611 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0106  serine/threonine protein kinase  38.8 
 
 		 674 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4380  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.32 
 
 		 1153 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594701  normal  0.339679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0406  serine/threonine protein kinase  36.16 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1974  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.19 
 
 		 481 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1920  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0137132  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5538  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  37.38 
 
 		 721 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6081  serine/threonine protein kinase  33.05 
 
 		 542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.168714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2662  Serine/threonine protein kinase-like protein  35 
 
 		 814 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00893552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2699  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 743 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0467419  normal  0.85773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4679  serine/threonine protein kinase  32.08 
 
 		 590 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.71 
 
 		 723 aa  131  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7433  Serine/threonine protein kinase-like protein  36.17 
 
 		 664 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3968  serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0668  Serine/threonine protein kinase-like protein  35.62 
 
 		 464 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>