More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6039 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6039  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 301 aa  605  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5305  serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 645 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.704424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1394  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 501 aa  87.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.860745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 707 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 		 719 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  35.92 
 
 		 468 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.82 
 
 		 607 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4070  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 610 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1111  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 		 741 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 		 651 aa  77.8  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.51 
 
 		 1044 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2845  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.985984  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3644  protein kinase  32.45 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0238226  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  31.22 
 
 		 824 aa  77  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65306  Serine/threonine-protein kinase  28.14 
 
 		 703 aa  77.4  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145974  normal  0.837737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.9 
 
 		 518 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2110  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 		 493 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  32.38 
 
 		 597 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 		 513 aa  76.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  31.54 
 
 		 623 aa  76.6  0.0000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.06 
 
 		 1072 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 		 619 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2040  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00475654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  32.35 
 
 		 615 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3116  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.63 
 
 		 878 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3630  serine/threonine protein kinase  30.35 
 
 		 594 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547805 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3623  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 		 715 aa  75.5  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.569481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3084  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 766 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00699  cell division protein kinase (Ctk1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13600)  28.02 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2648  serine/threonine protein kinase  30.69 
 
 		 578 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0958386 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1820  serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.672727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.07 
 
 		 1076 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1813  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0382  serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 583 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5936  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 		 1029 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 		 990 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.07 
 
 		 1072 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0027  serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 		 529 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6755  serine/threonine protein kinase  28.91 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.11 
 
 		 598 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  31.16 
 
 		 1032 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4665  protein kinase  35.42 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3166  serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 		 606 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2796  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 982 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0264511  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01100  proliferation-associated serine/threonine protein kinase, putative  28 
 
 		 575 aa  73.2  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  30.61 
 
 		 1032 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7672  Serine/threonine protein kinase-like protein  31.3 
 
 		 650 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4058  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 		 552 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.229235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2445  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.96 
 
 		 896 aa  73.2  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 		 1122 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29 
 
 		 916 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2983  serine/threonine protein kinase  27.18 
 
 		 982 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.28698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  30.24 
 
 		 537 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 460 aa  72.8  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0929  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 607 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0956  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 607 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0106  Serine/threonine protein kinase-like  26.84 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04279  cell-cycle checkpoint serine-threonine kinase (Eurofung)  27.72 
 
 		 630 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.631432 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0928  serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 		 761 aa  71.6  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000612403  hitchhiker  1.21149e-16 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 776 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1202  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101789  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  27.96 
 
 		 1398 aa  72  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1754  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00149548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 956 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2891  serine/threonine protein kinase  27.85 
 
 		 985 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.242068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5798  serine/threonine protein kinase  36.43 
 
 		 565 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 		 746 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1074  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 614 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1133  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1202  serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 		 695 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0753061  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  29.7 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3726  serine/threonine protein kinase  33.77 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8996  predicted protein  25.85 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.14 
 
 		 603 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.319641 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05973  serine/threonine protein kinase (YPK1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10620)  27.36 
 
 		 640 aa  70.1  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.403248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  26.09 
 
 		 692 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7673  protein kinase  29.1 
 
 		 572 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.683245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3423  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 509 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.931236  normal  0.508878 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  34.67 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 880 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5188  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 625 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3488  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 		 524 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.562336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  32.55 
 
 		 646 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2134  serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 564 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 		 589 aa  69.3  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 		 585 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.95 
 
 		 661 aa  69.3  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4235  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  31.45 
 
 		 662 aa  69.3  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68332  carbon catabolite derepressing ser/thr protein kinase  27.88 
 
 		 580 aa  69.3  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.721612 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  27.98 
 
 		 667 aa  69.3  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 569 aa  69.3  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3652  serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0635  serine/threonine protein kinase  30.27 
 
 		 721 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.630514  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4246  serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 		 623 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8510  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.63 
 
 		 596 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  28.17 
 
 		 691 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>