122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0280 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 237 aa  489  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  48.17 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  42.32 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  42.42 
 
 		 236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  45.18 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  44.38 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.16 
 
 		 278 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.89 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.81 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  38.89 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  38.89 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  39.88 
 
 		 276 aa  122  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.29 
 
 		 276 aa  121  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.29 
 
 		 276 aa  121  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.76 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  38.32 
 
 		 271 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.9 
 
 		 275 aa  98.6  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.81 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.15 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.77 
 
 		 267 aa  95.1  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.18 
 
 		 274 aa  95.1  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.13 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.72 
 
 		 275 aa  93.6  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.5 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.04 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  34.63 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.16 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.64 
 
 		 280 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  32.02 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  33.14 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.5 
 
 		 252 aa  89  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.17 
 
 		 246 aa  88.6  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.31 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  30.05 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  36.05 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  35.56 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.11 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.43 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  30.64 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  30.99 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.09 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  31.33 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  30.52 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.41 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.74 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  30.71 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.78 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  28.96 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.27 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  34.88 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.5 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.79 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.79 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06031  protein ligase  31.41 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.23 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  30.56 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  33.8 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.37 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  25.76 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  30 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.23 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.23 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  31.1 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  26.74 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.86 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.8 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.73 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  24.9 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.14 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.68 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  26.85 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  25.3 
 
 		 326 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  25.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  25.68 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.28 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.57 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.19 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.04 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1254  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.89 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  23.67 
 
 		 336 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.92 
 
 		 349 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  24.5 
 
 		 349 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  24.84 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0262  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.89 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0487982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>