151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0396 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3151  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.79 
 
 		 280 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.857047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0393  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.95 
 
 		 267 aa  289  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.50261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  54.75 
 
 		 275 aa  289  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0399  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.65 
 
 		 266 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  49.81 
 
 		 271 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0379  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  53.99 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  37.23 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.13 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.33 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.82 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.82 
 
 		 276 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  32.23 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  32.23 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  31.87 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  31.87 
 
 		 278 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  31.87 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  31.87 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  31.87 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  31.87 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  31.87 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2867  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.56 
 
 		 261 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.5 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  30.51 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.31 
 
 		 273 aa  135  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  30.83 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1659  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.92 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.368883  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0906  lipoate-protein ligase A, putative  34.71 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  39.67 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0676  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.82 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1527  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.17 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1629  biotin/lipoate A/B protein ligase  33.77 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  36.92 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0900  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.84 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3831  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.73 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.589903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1477  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.24 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.364257 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.22 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2597  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.71 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1329  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.36 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1007  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.35 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.235088 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1329  lipoate-protein ligase A-like  33.75 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4350  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.81 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0344715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.57 
 
 		 530 aa  94.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0280  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.72 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000980162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0328  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.61 
 
 		 259 aa  92  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07881  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  27.94 
 
 		 258 aa  92  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.34 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0222  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.52 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0220  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.07 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.99 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  25.84 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3177  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.5 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.72 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.57 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4737  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.25 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0174196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.99 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1628  protein ligase  30.61 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1411  hypothetical protein  32.06 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0735  protein ligase  34.62 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.308354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.37 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3358  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.87 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.04 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2744  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.87 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  24.9 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0851  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.55 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2150  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.81 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.863848 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.48 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  31.37 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0539  protein ligase  28.64 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.728191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  24.43 
 
 		 334 aa  68.9  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  28.81 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  24.44 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  25.67 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05411  protein ligase  25.87 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  24.15 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  24.15 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  26.84 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05651  protein ligase  29.35 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.328007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.15 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  33.33 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  25.22 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  25.22 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  25.22 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  24.15 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  25.22 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  25.22 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.52 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.52 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.98 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  28.57 
 
 		 363 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  24.15 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  24.03 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.62 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.71 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1346  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.98 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107547 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1869  lipoate-protein ligase A  25.39 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.957492  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  29.68 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  23.5 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05951  protein ligase  28.04 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05941  protein ligase  24.87 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>