160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1172 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  100 
 
 
358 aa  709    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  65.18 
 
 
349 aa  464  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  70.11 
 
 
358 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  61.45 
 
 
349 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  59.22 
 
 
364 aa  424  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  59.34 
 
 
354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  58.54 
 
 
372 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  61.45 
 
 
349 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.38 
 
 
349 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.54 
 
 
365 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  54.47 
 
 
352 aa  376  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  59.3 
 
 
257 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.42 
 
 
261 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.2 
 
 
261 aa  292  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  53.12 
 
 
259 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  54.07 
 
 
253 aa  223  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  34.16 
 
 
245 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02600  hypothetical protein  44.52 
 
 
220 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.45 
 
 
327 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  33.89 
 
 
325 aa  105  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0964  hypothetical protein  57.58 
 
 
91 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal  0.241278 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  30.54 
 
 
336 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  28.45 
 
 
329 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27 
 
 
329 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.28 
 
 
530 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.03 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.67 
 
 
326 aa  94  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  30.53 
 
 
332 aa  93.6  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  33.52 
 
 
333 aa  93.6  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.74 
 
 
278 aa  92.8  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  26.14 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1515  hypothetical protein  53.54 
 
 
94 aa  92  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.648993  hitchhiker  0.00942142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  30.88 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.69 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.62 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0451  hypothetical protein  56.57 
 
 
92 aa  90.1  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  28.42 
 
 
328 aa  89.7  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3412  hypothetical protein  50.51 
 
 
94 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.010842  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
329 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  30.43 
 
 
329 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.95 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  30.6 
 
 
337 aa  89  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.95 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.43 
 
 
329 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  29.03 
 
 
331 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  26.67 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.46 
 
 
325 aa  88.6  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.89 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  27.65 
 
 
326 aa  86.7  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0219  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.8 
 
 
278 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  23.53 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.5 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  24.27 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  25.73 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  24.1 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.51 
 
 
332 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.85 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.46 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  31.31 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  27.67 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  24.77 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.59 
 
 
357 aa  75.9  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.17 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.26 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  22.89 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.36 
 
 
273 aa  74.7  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.1 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.1 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  25.1 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  23.16 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  23.24 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  23.24 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  23.16 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  28.25 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  27.32 
 
 
363 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.47 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  20.22 
 
 
278 aa  72  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  29.13 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  27.17 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  29.13 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  27.17 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  27.17 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  26.02 
 
 
562 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0396  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.37 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  29.13 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  29.13 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0532  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.62 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.870204 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  25 
 
 
240 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>