160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1006 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  97.57 
 
 
329 aa  659    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  98.48 
 
 
329 aa  663    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  97.87 
 
 
329 aa  661    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  97.87 
 
 
329 aa  661    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  97.87 
 
 
329 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  97.87 
 
 
329 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  97.87 
 
 
329 aa  661    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  98.18 
 
 
329 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  93.92 
 
 
329 aa  637    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  100 
 
 
329 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  97.87 
 
 
329 aa  661    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  77.2 
 
 
329 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  56.1 
 
 
328 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  56.1 
 
 
328 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  53.96 
 
 
328 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  49.85 
 
 
326 aa  323  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  45.79 
 
 
331 aa  309  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  47.62 
 
 
329 aa  306  4.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  46.32 
 
 
329 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  47.53 
 
 
337 aa  300  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  45.08 
 
 
329 aa  296  5e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  43.93 
 
 
331 aa  295  9e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  44.21 
 
 
332 aa  291  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  43.96 
 
 
329 aa  288  6e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  45.73 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  41.21 
 
 
345 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.19 
 
 
327 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  41.03 
 
 
326 aa  261  8.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.37 
 
 
340 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.37 
 
 
340 aa  257  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  39.7 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  40.73 
 
 
339 aa  252  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  39.02 
 
 
333 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  40.19 
 
 
336 aa  249  3e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  40.94 
 
 
325 aa  248  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  35.98 
 
 
334 aa  226  4e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  37.8 
 
 
332 aa  212  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  38.91 
 
 
343 aa  209  8e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  36.11 
 
 
334 aa  205  1e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  34.88 
 
 
334 aa  200  3e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  33.44 
 
 
332 aa  188  9e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  36.25 
 
 
339 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  30.82 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  34.85 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  33.8 
 
 
334 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  34.22 
 
 
338 aa  182  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
338 aa  182  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  33.22 
 
 
337 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  33.65 
 
 
337 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  35.25 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
338 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  34.53 
 
 
338 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.2 
 
 
338 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
338 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  34.2 
 
 
338 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  32.14 
 
 
338 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  34.2 
 
 
562 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
338 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
338 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
338 aa  177  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  33.88 
 
 
338 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  34.2 
 
 
338 aa  176  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  33.22 
 
 
338 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  32.11 
 
 
338 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  32.11 
 
 
338 aa  172  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  32.11 
 
 
338 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  30.48 
 
 
338 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  27.86 
 
 
396 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58727  predicted protein  30.58 
 
 
475 aa  119  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0291322 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  35.96 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  36.68 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  33.33 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.27 
 
 
530 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.22 
 
 
360 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  32.14 
 
 
356 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  32.14 
 
 
356 aa  100  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  27.48 
 
 
363 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  28.11 
 
 
349 aa  96.3  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  27.8 
 
 
247 aa  95.9  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.43 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.36 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  35.39 
 
 
365 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.77 
 
 
343 aa  92.4  8e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.85 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.37 
 
 
278 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  27.01 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  27.01 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  27.01 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  27.01 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  27.01 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  27.01 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  27.01 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  27.01 
 
 
278 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  27.01 
 
 
278 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  29.89 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.27 
 
 
278 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.16 
 
 
357 aa  86.7  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  30.6 
 
 
257 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2899  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.35 
 
 
278 aa  86.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.237083  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  26.85 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>